Odniósł jednak wtedy największy sukces awansując w pucharze Polski do 1/16 finału, gdzie uległ warszawskiej Legii 0:3.
Po regulaminowym przeniesieniu klubu o dwie klasy niżej Bucovia rozpoczęła rozgrywki w klasie okręgowej i występowała w niej do 2007, kiedy to wywalczyła awans do IV ligi świętokrzyskiej. W sezonie 2007/2008 drużynie nie dane było dokończyć rozgrywek. Od początku w klubie z Krasocina były problemy finansowe, ale po zakończeniu rundy jesiennej okazało się, że w gminie Krasocin nie było pieniędzy na utrzymanie drużyny seniorów. W rundzie wiosennej Bucovia przegrała wszystkie mecze walkowerem. W kolejnych rozgrywkach klub wystąpił jedynie w pucharze Polski na szczeblu okręgu, docierając do trzeciej rundy, w której został pokonany przez Skałę Tumlin. W sezonie 2009/2010 zespół wywalczył awans do klasy A.