Wedle zeznań świadków Tröger miał osobiście podpisywać listy z nazwiskami Polaków skazanych na śmierć.
Dr Tröger posiadał w tym czasie stopień SS-Sturmbannführera oraz obejmował stanowisko dyrektora rządowego (Regierungsdirektor). Mimo stosunkowo niskiego stopnia był jednak niewątpliwie jednym z ważnych współpracowników partyjnego kierownictwa Okręgu Gdańsk-Prusy Zachodnie oraz partnerem w rozmowach z gauleiterem Albertem Forsterem. W listopadzie 1939 Tröger został mianowany Inspektorem Policji Bezpieczeństwa (IdS) w Gdańsku, którą to funkcję pełnił do połowy stycznia 1940. Po formalnym zakończeniu Intelligenzaktion brał udział w planowaniu i przeprowadzaniu masowych wysiedleń Polaków zamieszkujących świeżo utworzony Okręg Gdańsk-Prusy Zachodnie. Szczególny nacisk kładł zwłaszcza na konieczność wypędzenia z Pomorza rodzin Polaków zamordowanych w trakcie operacji „politycznego oczyszczania terytorium”.