W okresie międzywojennym została przebudowana wieża, usunięto prawosławne malowidła oraz ogrodzono kościół i cmentarz. W 1937 roku zostały zorganizowane misje święte. Kiedy wybuchła II wojna światowa, proboszczem był Franciszek Zenta, który musiał opuścić budynek świątyni, którą zajęli Ukraińcy. Plebania została zamieniona na posterunek ukraińskiej milicji.
4 lutego 1945 z Sokołowa do Werbkowic przybył Franciszek Klinger. Kościół był zniszczony, lecz wkrótce przystąpiono do remontu. Oprócz sprzętów liturgicznych, przywieziony został obraz Matki Bożej Nieustającej Pomocy. 18 marca 1945 kościół został poświęcony przez ks. Klingera za pozwoleniem Kurii. Pierwsza uroczystość odpustowa odbyła się 1 lipca 1956. W 1986 roku Klinger został przeniesiony na emeryturę, a jego następcą został Adam Marek, który kontynuował inicjatywy duszpasterskie i gospodarcze poprzednika.