Topniejący lodowiec pozostawił zagłębienia, w których powstały liczne jeziora, spośród których największym jest Imandra (powierzchnia 876 km²).
Poza wodami powierzchniowymi na terenie obwodu istnieją bogate zasoby wód podziemnych.
Część wód jest uwięziona w ziemi z powodu wiecznej zmarzliny, występującej na ok. połowie obszaru obwodu murmańskiego.
Rzeki Największymi rzekami regionu są (w kolejności alfabetycznej): Jokanga Kola Łotta Niwa Ponoj Purnacz Strielna Tułoma Tumcza Umba Warzuga Woronja
Dzięki korzystnemu ukształtowaniu powierzchni połączonemu z dużą ilością cieków wodnych istotne znaczenie w gospodarce rejonu odgrywa hydroenergetyka. Łączna moc miejscowych elektrowni wodnych od początku XXI wieku wynosi ok. 3 mld. kWh/rok.
Jeziora Największe jeziora (w kolejności alfabetycznej): Czudziawr Imandra Jenoziero Kanoziero Łowoziero Umboziero
Gleby Na terenie obwodu przeważają typy gleb nie przedstawiające znaczenia pod względem rolniczym. Zaliczą się do nich gleby bielicowe, bielicowe iluwialno-humusowe i bielicowe tundrowe.