Z nagromadzonych zapasów zaopatrzono armię Fryderyka II walczącą w wojnie siedmioletniej. Zapewne z tego względu król pruski zaproponował Brenckenhoffowi przejście do służby państwowej Prus.
W czerwcu 1762 r. otrzymał stanowisko tajnego radcy finansowego i członka dyrektorium. Faktycznie sprawował on funkcję prezydenta regencji na obszarze Pomorza i Nowej Marchii. W trakcie swej działalności zajmował się głównie odbudową spustoszonych wojną miast, a także osuszaniem łąk nad Notecią i możliwością wykorzystania ich do upraw rolniczych. Jego siedzibą było wówczas Drezdenko.
Organizator Obwodu Nadnoteckiego Krótko przed I rozbiorem Polski, 6 lutego 1772 r., Fryderyk II powierzył mu tajną misję, której celem było zorientowanie się w możliwościach i stanie gospodarczym planowanych do aneksji ziem polskich. W tym celu Brenkenhoff wykorzystywał znajomość z hrabiną Skórzewską. Gościł w jej pałacu w Lubostroniu wiosną 1772 r., zbierając równocześnie informacje dotyczące ilości miast i wsi, ich zaludnienia, struktury narodowościowej itp. Zainteresował się także stanem dróg wodnych, zwłaszcza Noteci, której coroczne wylewy niszczyły uprawy majątku Skórzewskich. Wtedy prawdopodobnie zrodził się pomysł połączenia Noteci z Brdą. Obserwacje swoje zrelacjonował Fryderykowi II w czerwcu 1772 r.