W 1572 roku w mieście doszło do rzezi protestantów, a po wydaniu w 1682 roku przez Ludwika XIV edyktu z Fontainebleau społeczność protestancka opuściła Troyes. Wydarzenie to, podobnie jak nieprzerwanie trwające w mieście niepokoje i rosnące podatki spowodowały, że miasto utraciło na znaczeniu. Ponowny rozwój nastąpił dopiero w XIX wieku.
Zabytki odrestaurowane Stare Miasto z domami z wieków XVI–XVIII gotyckie i renesansowe kościoły: katedra św. św. Piotra i Pawła (XIII–XVII wiek) ze skarbcem i witrażami datowanymi na XIII–XVI wiek bazylika św. Urbana I, dawniej kościół zakonny św. Urbana, ufundowany przez papieża Urbana IV (XIII–XIX wiek) kościół św. Jana (XIV–XVII wiek) kościół św. Magdaleny (XII–XVI wiek) z lektorium w stylu flamboyant (1508–1516) kościół renesansowy Saint-Martin-des-Vignes (1589–1610) kościół Saint-Rémy (XIV–XVI wiek) kościół Saint-Pantaléon (XVI wiek) z barokową fasadą Muzeum Sztuki Współczesnej w Pałacu Biskupim (XVI–XVIII wiek) Muzeum Saint-Loup (sztuki piękne, archeologia, historia naturalna) w opactwie Saint-Loup (XVII/XVIII wiek) apteka l’Hôtel Dieu-le-Comte (muzeum farmacji), XVIII wiek Musée de Vauluisant w Hôtel de Vauluisant (XVI wiek) Maison de l’outil et de la Pensée Ouvrière w Hôtel de Mauroy (XVI wiek) – największa na świecie kolekcja narzędzi z VII i VIII w.