Brygada Ecjoni uczestniczyła w operacji Jewusi (22 kwietnia-3 maja 1948), w której po raz pierwszy Hagana użyła siły większe niż jedna brygada (drugą była Brygada „Harel”). W dniach 2–3 maja 61 batalion zdobył dzielnicę Katamon i otworzył drogę do izolowanego osiedla Mekor Chajjim. Na początku maja, Jisra’el Galili utworzył w Tel Awiwie rezerwowy 64 batalion. Brygadzie „Ecjoni” były podporządkowane wszystkie siły Straży i batalionów młodzieżowych Gadna w obszarze Jerozolimie. W sumie były to siły o wielkości pięciu batalionów piechoty. Wielkim wstrząsem dla wszystkich żydowskich żołnierzy była klęska w trzeciej bitwie o Gusz Ecjon (12–13 maja 1948 r.). Szczególnie ciężkie straty poniósł wówczas 63 batalion, który został 21 maja 1948 rozwiązany. Pozostałych po nim żołnierzy rozrzucono po innych batalionach brygady. Sytuacja ta bardzo niekorzystnie wpłynęła na morale żołnierzy, a w rezultacie pogłębiły się problemy z dyscypliną. Pomimo to, brygada wzięła udział w operacji Szfifon (13 maja 1948), wspierając siły Irgunu i Lechi przy przejmowaniu opuszczanych przez Brytyjczyków pozycji na Starym Mieście Jerozolimy. Podczas operacji Kilszon (13–18 maja 1948) brygada rozwinęła natarcie w kilku dzielnicach Jerozolimy.