W 1932 otrzymał godność archimandryty.
Według informacji podanych przez eparchię woroneską i borysoglebską w 1933 archimandryta Aleksy w 1933 poinformował radzieckie organy ścigania o dalszym funkcjonowaniu zdelegalizowanego Monasteru Wysoko-Pietrowskiego oraz organizacji przy nim Akademii Duchownej. Wskutek jego doniesienia aresztowano 24 osoby, zaś w ich procesie archimandryta Aleksy występował jako świadek oskarżeniaПРЕПОДОБНОМУЧЕНИК ФЕОДОР (БОГОЯВЛЕНСКИЙ).
W 1935 locum tenens Patriarchatu Moskiewskiego metropolita Sergiusz nominował archimandrytę Aleksego do przyjęcia chirotonii biskupiej z tytułem biskupa kaszyrskiego, wikariusza eparchii moskiewskiej. Obrzęd odbył się 20 maja 1935 w cerkwi Narodzenia Matki Bożej w Moskwie-Putinkach z udziałem metropolity Sergiusza, arcybiskupa dmitrowskiego Pitirima oraz biskupa bronnickiego Sergiusza. Od 1936 był biskupem sierpuchowskim. 5 sierpnia 1937 został wyznaczony do objęcia katedry wołogodzkiej, jednak nigdy nie udał się do Wołogdy. Jeszcze w tym samym roku, 16 sierpnia, został ponownie wikariuszem eparchii moskiewskiej z tytułem biskupa jegoriewskiego, zaś 1 września objął katedrę iwanowską. W 1938 przestał popierać stanowisko metropolity Sergiusza, zachowującego mimo nasilonych prześladowań Rosyjskiego Kościoła Prawosławnego lojalność wobec władz państwowych.