Działalność naukowa Od 1958 roku był kolejno asystentem, starszym asystentem i adiunktem w Katedrze Astronomii Uniwersytetu Warszawskiego. W 1965 roku został zatrudniony w Zakładzie Astronomii PAN jako docent (1965–1971) i profesor (1971–). Zakład Astronomii zmienił nazwę na Centrum Astronomiczne im. Mikołaja Kopernika 11 lutego 1976 roku. Józef Smak był dyrektorem Zakładu/Centrum w latach 1974–1981, w czasie, gdy wybudowano nowy budynek Centrum (otwarty 24 maja 1978 roku) i wyposażono je w supernowoczesny wtedy amerykański komputer PDP-11/45. Ponownie był dyrektorem Centrum w latach 1995–1998, a w latach 1984–1986, 1993–1995 i ponownie od 2007 roku był przewodniczącym Rady Naukowej Centrum.
Józef Smak razem z Bohdanem Paczyńskim byli inicjatorami budowy Centrum, którego koncepcję przedstawili 2 marca 1970 roku.
Smak przebywał na licznych stażach naukowych, był m.in.: assistant astronomer w Obserwatorium Licka i w University of California (1963–1965), w Observatoire de Haute-Provence (1966), distinguished visiting professor w Ohio State University (1973–1974), visiting professor w University of California, Los Angeles (1989).
Brał udział w pracach Centralnej Komisji ds.