Jest znany jako twórca koncepcji naprzemiennych okresów „cieplarni” i „chłodni”, opracowanej na podstawie wyników badań stratygraficznych. Zasugerował istnienie w historii Ziemi stosunkowo regularnie występujących okresów masowego wulkanizmu (ok. 32 mln lat) i okresów dużej bioróżnorodności (ok. 27 mln lat). Zaobserwowane cykle są nazywane „cyklami oceanicznymi” lub „megacyklami Fischera”. Uzasadnieniem pierwszej nazwy jest fakt, że przejścia cieplarnia–chłodnia–cieplarnia–... Fischer powiązał z charakterystycznymi zmianami termicznej stratyfikacji wód oceanów (zob. stratyfikacja termiczna wody w jeziorze).
Publikacje Tematykę opracowań naukowych ilustrują np. publikacje: Henry Van Wagenen @Howe, Alfred George Fischer, New Tertiary Ostracode Fauna from Levy County, Florida (1951), Alfred George Fischer, The Echinoid Fauna of the Inglis Member, Moodys Branch Formation (1951), Henry Van Wagenen @Howe, Alfred George Fischer, The Echinoid Fauna of the Inglis Member, Moody Branch Formation (1951), Howard T. Odum, Alfred George Fischer, Pt. I Dissolved Phosphorus in Florida Waters: Pt. II Petrology of Eocene Limestones in and Around the Citrus-Levy County Area, Florida (1953), Alfred G. Fischer, Latitudinal Variations in Organic Diversity (1960),