Szczepienie przeciw KZM jest zalecane przez Ministerstwo Zdrowia dzieciom >12 m-ca życia, osobom przebywającym na terenach endemicznych: zatrudnionym przy eksploatacji lasów, stacjonującemu w lasach wojsku, rolnikom, młodzieży odbywającej praktyki oraz turystom, uczestnikom obozów i kolonii.
Dla zapewnienia odpowiedniego zabezpieczenia niezbędne jest uodpornienie podstawowe przez podanie szczepionki. Żeby szczepionka działała pewnie i długoczasowo, pobudza się układ obronny organizmu do tworzenia przeciwciał obronnych przez trzyetapowe szczepienie. Później podawane jest szczepienie przypominające.
1. Szczepienie podstawowe.
Szczepienia ochronne przeciw kleszczowemu zapaleniu mózgu. I dawka 0,5 ml tak wcześnie, jak to możliwe najlepiej w zimnym okresie roku II dawka 0,5 ml 1–3 m-ce po pierwszym szczepieniu III dawka 0,5 ml 9–12 m-cy po drugim szczepieniu
2. Szczepienie przypominające.
Co trzy lata jedno szczepienie przypominające. W ten sposób zostaje zapewnione właściwe zabezpieczenie. Na terenach zagrożonych powinno się szczepić dzieci już od pierwszego roku życia, ponieważ spędzają one dużo czasu na dworze.