Organizacja Organizacyjnie WVHA dzieliło się na 5 urzędów (oznaczonych literami A, B, C, D i W): A – Administracja Oddziałów SS (Amtsgruppe A – Truppenverwaltung): zajmował się administracją oddziałów Waffen-SS B – Gospodarka Oddziałów SS (Amtsgruppe B – Truppenwirtschaft): zajmował się gospodarką formacji SS C – Zagadnienia Budowlane (Amtsgruppe C – Bauwesen): zajmował się budownictwem D – Obozy Koncentracyjne (Amtsgruppe D – Konzentrationslager) (włączony do WVHA w marcu 1942): której podlegały obozy koncentracyjne (kierował nim SS-Gruppenführer Richard Glücks), zarządzane przez Inspektorat Obozów Koncentracyjnych (Inspektion der Konzentrationslager). W – Przedsięwzięcia Gospodarcze (Amtsgruppe W – Wirtschaftliche Unternehmungen): tzw. „Amstgruppe W”, nadzorująca firmy i przedsiębiorstwa, będące własnością SS. Jedną z pierwszych firm tego typu było Deutsche Erd- und Steinwerke GmbH (DEST).

Osądzenie zbrodni po wojnie