Lata 1863-1865 – powstanie styczniowe i więzień stanu Wraz z wybuchem powstania styczniowego był gotów spełnić swą powinność wobec ojczyzny. Ze względu na wiek nie brał już jednak czynnego udziału w walce, ale organizował pomoc dla powstania. Decyzją Rządu Narodowego został mianowany Naczelnikiem Obwodu SamborskiegoPor. Bibliografia poz. 18 (s. 16), 19 (s. 239).. Wiosną 1864 r. po ogłoszeniu stanu oblężenia w Galicji, został aresztowany 15 marca 1864 r. i skazany na 2 lata więzienia. Więziony we Lwowie, a następnie jak inni więźniowie stanu, przewieziony 24 maja 1864 r. do Ołomuńca, uwolniony dopiero na skutek ogólnej amnestii 18 listopada 1865 r.Por. Bibliografia poz. 3, 4.
Działalność społeczna i polityczna w ramach autonomii (1861-1887) Henryk Janko oddany był pracy organicznej i pracy u podstaw Angażował się w działalność społeczną m.in. na polu oświaty ludowej – w Hoszanach założył szkołę, a w Rudkach bibliotekę i czytelnię. Działał aktywnie na rzecz podniesienia kultury rolnej i efektywności gospodarki rolnej. Już w 1861 r. został wybrany członkiem Rady Powiatowej w Rudkach, a także członkiem jej Wydziału. Pełnił wiele funkcji w różnych organizacjach m.in.Por. Bibliografia poz. 20.: Prezes Oddziału Rudeńsko-Grodeckiego c.k.C.k. (niem. k.u.k)– skrót od „cesarsko-królewski”.