One Championship 28 października 2018 doszło do porozumienia w sprawie przejścia Johnsona do singapurskiej organizacji One Championship, natomiast w ramach wymiany zawodników do UFC przeszedł niepokonany Ben Askren. W debiucie dla One Championship 31 marca 2019 pokonał Japończyka, Yuyę Wakamatsu przez poddanie w drugiej rundzie, co dało mu również awans do półfinału turnieju wagi muszej. W półfinale pokonał innego Japończyka, Tatsumitsu Wada (2 sierpnia 2019), a w finale Tajlandczyka, Danny'ego Kingada (13 października 2019). Obie walki zakończyły się decyzją jednogłośną na korzyść Johnsona.
7 kwietnia 2021 zawalczył o pas mistrzowski One Championship w wadze muszej. Przegrał tę walkę przez nokaut (kolano i ciosy w parterze) w drugiej rundzie z Brazylijczykiem, Adriano Moraesem.
27 sierpnia 2022 na gali One on Prime Video 1 doszło do rewanżowego, mistrzowskiego starcia Moraes-Johnson. Tym razem lepszy okazał się być Johnson, który znokautował latającym kolanem w czwartej odsłonie Brazylijczyka, dzięki czemu stał się nowym mistrzem wadze muszej.
5 maja 2023 na gali One on Prime Video 10 w Broomfieldzie po raz trzeci została zorganizowana walka Johnsona z Moraesem. Trylogię po pięciorundowej batalii zwyciężył ponownie „Mighty Mouse”, tym samym broniąc po raz pierwszy pas mistrzowski One Championship w wadze muszej.