Zainteresowania naukowe Zainteresowania naukowe Marii Dudzikowej koncentrowały się wokół problematyki socjopedagogicznego i psychopedagogicznego funkcjonowania szkoły w Polsce na tle oczekiwań społecznych i skutków jej działalności, metodologii badań pedagogicznych oraz procesów i działalności jednostki oraz jej uwarunkowaniami osobowościowymi i socjalizacyjnymi. Ponadto zajmowała się zagadnieniami szkoły jako podmiotu zmian i miejsca rozwoju ucznia, życia codziennego w szkole oraz autokreacji, wychowania i enkulturacji. Autorka około dwustu prac z dziedziny pedagogiki.
Główne prace Wychowanie w toku procesu lekcyjnego, 1979 O trudnej sztuce tworzenia samego siebie, 1985 Wychowanie przez aktywne uczestnictwo, 1987 Praca młodzieży nad sobą, 1993 Osobliwości śmiechu uczniowskiego, 1996 Nauczyciel-uczeń. Między przemocą a dialogiem. Obszary napięć i typy interakcji, 1996 Mit o szkole jako miejscu „wszechstronnego rozwoju” ucznia. Eseje etnopedagogiczne, 2002 Pomyśl siebie... Minieseje dla wychowawcy klasy, 2007 Wychowanie: pojęcia, procesy, konteksty: interdyscyplinarne ujęcie, t.