W 1090 roku arcybiskupi podarowali stary już wówczas kościół parafialny benedyktynom z klasztoru św. Albana w Moguncji, którzy założyli przy nim swój klasztor, a w 1298 przenieśli do macierzystego kościoła w Moguncji relikwie patrona kościoła w Höchst am Main. Tenże otrzymał wówczas wezwanie św. Małgorzaty, które nosi w sensie liturgicznym formalnie do dziśZarówno literatura fachowa, jak i publikacje katolickiej parafii św. Józefa, do której należy kościół, określają go pierwotnym wezwaniem jako Justinuskirche., a początkowe wezwanie zostało przejściowo zapomniane i szerzej rozpropagowane przez historyków w końcu XIX wieku, którzy odkryli karolińską genezę kościołaPrzekonujących argumentów dostarczyli F. Falk i Heckmann w 1882 i 1884 roku; wcześniej kościół niesłusznie uchodził za dzieło z końca XI wieku.. Od 1419 kościół służył ponownie wyłącznie potrzebom parafii, aż w 1441 przejęli go antonici, którzy wkrótce rozpoczęli budowę gotyckiego prezbiterium. Odtąd aż do kasaty zakonu w roku 1802 nawy służyły parafianom, a oddzielone początkowo przez lektorium prezbiterium zakonnikom.