Ferdynand liczył jednak na wsparcie Francji i Austrii w odzyskaniu praw do tronu, co obiecały w traktacie w Villafranca. Żadne z państw jednak nie podjęło ku temu kroków, tym samym torując drogę do powstania zjednoczonych Włoch. Królestwo Sardynii ostatecznie zaanektowało Wielkie Księstwo Toskanii 22 marca 1860, formalnie pozbawiając Ferdynanda państwa i władzy.
Były wielki książę spędził resztę życia na wygnaniu głównie w Austrii. Od lata 1868 w sezonie letnim zamieszkiwał w Villa Toscana w mieście powiatowym Lindau położonym nad Jeziorem Bodeńskim. Zaś miesiące zimowe spędzał w starej rezydencji w Salzburgu, którą udostępnił mu cesarz Franciszek Józef IToskanatrakt bei der Fakultätsbibliothek für Rechtswissenschaften, Universität Salzburg.
Odznaczenia Wielki Mistrz Orderu Świętego Stefana (Toskania) Wielki Mistrz Orderu Świętego Józefa (Toskania) Wielki Mistrz Orderu Zasługi Wojskowej (Toskania) Order Złotego Runa (Austro-Węgry) Krzyż Wielki Orderu Świętego Stefana (Austro-Węgry) Medal Wojenny (Austro-Węgry) Odznaka za Służbę Wojskową dla Oficerów I Stopnia (Austro-Węgry) Brązowy Medal Jubileuszowy Pamiątkowy dla Sił Zbrojnych (Austro-Węgry)Staatshandbuch. Wiedeń: 1918, s.