Specjalizował się m.in. w leczeniu nowotworów piersi z uwzględnieniem operacji odtwórczych po mastektomii i rehabilitacji pooperacyjnej, leczeniu nowotworów głowy i szyi, raka przełyku, operacjach jelita grubego i resekcjach miąższu wątroby. W 1993 w Centrum Onkologii wraz z Krystyną Miką wdrożył ogólnopolski system rehabilitacji i powołał klub kobiet po mastektomii „Amazonki”.
Podczas wydarzeń sierpniowych w 1980 przyłączył się do skierowanego do władz komunistycznych apelu 64 naukowców, literatów i publicystów o podjęcie dialogu ze strajkującymi robotnikami.
Członek World Federation of Surgical Oncology Societies, prezes Organisation of European Cancer Institutes (1996–1999). Członek Towarzystwa Chirurgów Polskich, założyciel i prezes Polskiego Towarzystwa Chirurgii Onkologicznej, założyciel i w latach 1994–2006 prezes Towarzystwa Marii Skłodowskiej-Curie w Hołdzie.
Wybrane publikacje Andrzej Kułakowski, Pięćdziesiąt lat… służby, Agencja ATM, Warszawa 2003, . Andrzej Kułakowski, Głowy z Wawelskiej, Agencja ATM, Warszawa 2004, .