W 1963 przedstawił w Akademii Rolniczej we Wrocławiu pracę doktorską i uzyskał stopień doktora nauk technicznych, a następnie rozpoczął pracę na Politechnice Krakowskiej, gdzie w latach 1987–1991 funkcję dyrektora Instytutu Inżynierii Gospodarki Wodnej.
Należał do Światowego Związku Żołnierzy Armii Krajowej i Polskiego Zrzeszenia Inżynierów i Techników Sanitarnych (członek honorowy).
Odznaczenia Brązowy Krzyż Zasługi z Mieczami, Krzyż Armii Krajowej, Krzyż Partyzancki, Złoty Krzyż Zasługi, Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski, Zasłużony dla Kultury Polskiej (2001).
Bibliografia Życiorys Józefa Fiszera, Muzeum Historyczne Miasta Krakowa nekrolog, Dziennik Polski dnia 4 maja 2015 Józef Fiszer – Moje korzenie, Pamięci konspiratorów krakowskiego Kedywu AK Marta Paluch „Wspomnienia żołnierza batalionu „Skała” AK: Mieliśmy wspierać powstanie krakowskie” Gazeta Krakowska 2 sierpnia 2014