Po 1982 r. władza prezydencka zmieniała się sprawnie, co cztery lata za pomocą wyborów. W latach 1982–2009 urząd sprawowało 7 prezydentów. Ostatni z nich, Manuel Zelaya został pozbawiony stanowiska w wyniku zamachu stanu. Wydarzenie to wywołało krytykę na arenie międzynarodowej, lecz Zelaya nie powrócił do dotychczasowych obowiązków. Prezydentem tymczasowym został Roberto Micheletti, a po wyborach - Porfirio Lobo Sosa. Obecnie urząd prezydenta Hondurasu sprawuje Xiomara Castro.
Wybór Zgodnie z konstytucją Hondurasu z 11 stycznia 1982 roku, prezydent zostaje wybrany w wyborach powszechnych, równych i bezpośrednich większością zwykłą głosów. Wynik wyborów musi zostać potwierdzony przez Narodowy Trybunał Wyborczy, a w razie gdy ten nie będzie mógł się zebrać, przez Kongres Narodowy lub Sąd Najwyższyart. 236 Konstytucji. Kadencja prezydenta rozpoczyna się 27 styczniaart. 237 Konstytucji.