mały|240px|BOZPN - Zespoły występujące w III lidze (gr.II) w sezonie 1979/80 Jagiellonia Białystok przystąpiła do rozgrywek II grupy III ligi makroregionalnej (OZPN: Warszawa, Białystok, Łomża, Suwałki, Ostrołęka, Ciechanów, Olsztyn). III liga składała się z 8 grup, zespoły z 1 miejsc awansowały do 2 II Ligi (2 grupy).
Prawidłową nazwą rozgrywek w sezonie 1979/1980 powinna być Klasa "M", czyli Klasa Międzywojewódzka, właśnie pod taką nazwą były prowadzone rozgrywki. W późniejszym czasie przyjęło się traktować Klasę "M" jako III ligę, choć ta oficjalnie została przywrócona od sezonu 1980/81. Głównym powodem zapisywania w statystykach Klasy "M" jako III ligi jest fakt prowadzenia rozgrywek międzywojewódzkich (makroregionalnych), czyli takich samych jak III liga.
III poziom rozgrywkowy W związku z reorganizacja ligi w przyszłym sezonie (4 grupy zamiast 8), spadają zespoły z miejsc 9-15. Trener Zbigniew Bania po raz drugi wprowadził Jagiellonię do II ligi, tym razem z III ligi makroregionalnej. Białostoczanie zdominowali rozgrywki, w rundzie wiosennej nie przegrywając żadnego meczu (9-zw., 5-rem.). Drugi sezon w Jagiellonii zaliczył bramkarz Mirosław Sowiński, okazał się dużym wzmocnieniem zespołu, wpuszczając tylko 10 bramek. Sowiński pobił klubowy rekord, seria 871 minut (9 spotkań) bez straty gola.