Jagiellonia zadebiutowała przed własną publicznością 9 sierpnia 1987 r. meczem z Widzewem Łódź (1:1), bramkę dla „żółto-czerwonych” w 7 min. strzelił Jarosław Michalewicz. Mecz przeszedł do historii białostockiej piłki nożnej nie tylko z powodu sportowej rywalizacji, ale także ogromnego zainteresowania kibiców. Stadion wypełnił się do ostatniego miejsca, kibiców wpuszczono na bieżnię lekkoatletyczną oraz miejsca za bramkami. Według różnych źródeł mecz oglądało od 35000-40000 osób. Pierwsze zwycięstwo drużyna odniosła w 6 kolejce, przed własną publicznością w meczu z Szombierkami Bytom (1:0). W pierwszej rundzie Jagiellonia zapłaciła frycowe beniaminka, bolączką okazały się mecze wyjazdowe. Na koniec rundy jesiennej z 10 pkt. drużyna zajmowała 14 miejsce w tabeli. Fala niepowodzeń wymusiła zmiany, po 10. kolejce zwolniony został Janusz Wójcik, na jego miejsce przyszedł były jagiellończyk Mirosław Mojsiuszko. Zmiana trenera okazała się dobrym ruchem, w drugiej rundzie zespół prezentował się o wiele lepiej, szczególnie poprawiony został bilans meczów na wyjeździe. Do historii przeszedł mecz w Zabrzu, gdzie „Jaga” wygrała z liderującym i przyszłym mistrzem kraju Górnikiem 2:3. W ostatniej kolejce białostoczanie zwyciężyli u siebie Legię Warszawa 2:0, z 29 pkt.