GIS w przypadku zagrożenia bezpieczeństwa sanitarnego ma prawo wydawania organom Państwowej Inspekcji Sanitarnej poleceń dotyczących podejmowania działań zapobiegawczych, wykonywania czynności kontrolnych oraz prawo uzyskiwania informacji o sposobie realizacji zadań urzędu w tym zakresie. O wydaniu takiego polecenia Główny Inspektor Sanitarny zawiadamia właściwego miejscowo wojewodę lub starostęUstawa z dnia 14 marca 1985 r. o Państwowej Inspekcji Sanitarnej ()..
Struktura Główny Inspektorat Sanitarny składa się z następujących departamentów: Departament Bezpieczeństwa Zdrowotnego Człowieka w Środowisku Departament Bezpieczeństwa Żywności i Żywienia Departament Budżetu i Finansów Departament Jakości i Nadzoru Departament Nadzoru nad Chemikaliami Departament Prawny Departament Promocji Zdrowia i Komunikacji Społecznej Departament Usług Cyfrowych Departament Zapobiegania i Kontroli Chorób Zakaźnych Biuro Dyrektora Generalnego Biuro Głównego Inspektora.