W 1998 roku, region Bari stał się częścią Puntlandu, obwodu autonomicznego w północno-wschodniej Somalii. W Tymczasowej Konstytucji Regionalnego Rządu Puntland sformułowanej w 2001 roku uznają region Bari za wchodzący w skład tegoż obwodu. Obecnie władze Puntlandu nie zabiegają o uznanie międzynarodowe i uważają się za autonomiczną część SomaliiZobacz: Article 3.1. (Territory, Borders and Its Inviolability and Sacredness) of the Transitional Constitution of the Puntland Regional Government [w:] https://web.archive.org/web/20180413133230/http://www.puntlandgovt.com/puntland-constitution/.
W kolejnych latach Puntland zreorganizował swój wewnętrzny podział administracyjny, a region Bari został podzielony na dwie części: południową część, która mniej więcej pokrywa się z Qardho i Bayla, oraz nowy region Karkaar, który został podzielony na pięć nowych dzielnic: Qardho, Bandarbayla, Waciya, Rako i Hafun. Północna cześć zachowała swoją nazwę Bari i została podzielona na siedem dzielnic : cztery z nich zachowując swoje oryginalne nazwy Boosaaso, Iskushuban, Qandala i Alula, a także trzy nowe : Carmo, Ufayn i Bargal.