Ochronę przed skutkami broni masowego rażenia zapewnia system filtrowentylacji powietrza oraz hermetyczny kadłub. Bezpieczeństwo jednocześnie zwiększa standardowo montowany system aktywnej samoobrony opracowany przez biuro konstukcyjne KBM w Kołomnie. W jego skład wchodzą: czujniki wykrywania opromieniowania laserem i 12 wyrzutni amunicji dymotwórczej i termalnej. System ten reaguje na opromieniowanie wiązką laserową pojazdu z wrogiego dalmierza, po czym skutecznie maskuje wóz.
W 2S31 Wena można wyróżnić trzy przedziały: kierowania z przodu kadłuba, bojowy w środku przykryty nową, obrotową wieżą oraz ostatni - napędowy. Kierowca, swoje stanowisko ma centralnie w osi wozu w przedziale kierowania. Swoje miejsce zajmuje przez właz, a do obserwacji wykorzystuje komplet pryzmatycznych peryskopów. Pozostali członkowie załogi, działonowy, dowódca i ładowniczy, swoje stanowiska zajmują w wieży poprzez dwa oddzielne włazy umieszczone w stropie wieży.