W latach 1937–1942 pracował w parafii Perlat, skąd został przeniesiony do parafii Jubë k. Durrësu, gdzie pracował do 1945. W Perlacie był inicjatorem budowy szkoły. Nie skorzystał z możliwości opuszczenia kraju w listopadzie 1944, wraz z armią niemiecką i pozostał w Albanii. W lutym 1945 przeniósł się do Tirany. 2 marca 1945 został aresztowany przez funkcjonariuszy Departamentu Obrony Ludu w Durrësie. Oskarżony o działania wrogie wobec władz komunistycznych, a także o współpracę z okupantem został skazany na dwa lata więzienia. Trafił do więzienia 313 w Tiranie. Próba ucieczka z więzienia zakończyła się niepowodzeniem, a Marxen ponownie stanął przed sądem. Skazany na karę śmierci został rozstrzelany w lesie pod Tiraną wraz z dwoma innymi więźniami rankiem 16 listopada 1946. Miejsce jego pochówku pozostaje nieznane. Wiadomość o jego śmierci w 1947 dotarła do rodziny w Niemczech.
Marxen znajduje się w gronie 38 Albańczyków, którzy 5 listopada 2016 w Szkodrze zostali ogłoszeni błogosławionymi.