Po zjednoczeniu Niemiec prokuratura państwowa w Berlinie wznowiła dochodzenie, które ostatecznie doprowadziło w 1996 r. Rudolfa Müllera na ławę oskarżonych. W przebiegu tegoż stwierdzono, iż Müller istotnie winny był śmierci postrzelonego, wzięto jednak pod uwagę okoliczności obrony koniecznej. Sąd skazał Müllera na karę roku pozbawienia wolności w zawieszeniu. W mającym miejsce w 2000 r. postępowaniu apelacyjnym przed sądem federalnym podtrzymano wyrok, zmieniając jednak charakter przestępstwa na morderstwo z powodu udowodnionych przesłanek winy umyślnej. Wystosowane przez Müllera w listopadzie tego samego roku odwołanie zostało odrzuconeBVerfG, 2 BvR 1473/00 vom 30. November 2000..
6 sierpnia 2001 r. niemiecka stacja telewizyjna MDR wyemitowała film dokumentalny o niniejszych wydarzeniach, potwierdzając tym samym wszystkie dotychczasowe wyniki ustaleń policyjno-sądowych byłej NRD.