W latach 1980–1981 był zastępcą dyrektora Instytutu Matematyki UŁ, następnie był prodziekanem (1981-84) oraz dziekanem Wydziału Matematyki, Fizyki i Chemii UŁ (1984-1990). Był dyrektorem Studiów Doktoranckich w Instytucie Matematyki UŁ (1976-2010, z kilkuletnią przerwą). W 1984 roku został profesorem nadzwyczajnym, w 1990 roku profesorem zwyczajnym. W roku 1989 Rada Naukowa Międzynarodowego Centrum Matematycznego im. Stefana Banacha powierzyła mu kierowanie semestrem z teorii funkcji rzeczywistych. W latach 1996–1999 był członkiem Rady Głównej Szkolnictwa Wyższego, pełniąc funkcję Zastępcy Przewodniczącego Sekcji Uniwersytetów, był także ekspertem Państwowej Komisji Akredytacyjnej (2002-2002). W latach 1994–1998 pracował w Instytucie Matematyki Politechniki Łódzkiej.
W 1987 roku był promotorem profesora Z. Zahorskiego podczas uroczystości wręczenia mu doktoratu honoris causa Uniwersytetu Łódzkiego, zaś w 2010 roku był promotorem prof. Jana Stanisława Lipińskiego podczas uroczystości odnowienia doktoratu z okazji 50-lecia jego uzyskania na UŁ. Profesor Władysław Wilczyński przez około dwadzieścia lat był redaktorem Naczelnym czasopisma „Folia Mathematica”.