Malarz dokonał niewielkich zmian w stosunku do pierwotnego szkicu, święty na obrazie spogląda ku niebu, podczas gdy na rysunku leży na boku a jego oczy wpatrzone są w krucyfiks. Obecność szkiców przygotowawczych ułatwiła atrybucję dzieła. Radiografia obrazu wykazała, że Goya zamalował XVIII-wieczne płótno z podobizną św. Katarzyny Aleksandryjskiej niosącej miecz i palmę męczeństwa.
Opis obrazu Obraz o tematyce religijnej przedstawia ostatnie chwile św. Franciszka Ksawerego. Franciszek był jezuitą, jednym z pierwszych uczniów św. Ignacego Loyoli. Był misjonarzem Towarzystwa Jezusowego w krajach Orientu; od 1541 podróżował i nauczał w Indiach i Japonii, próbował także dotrzeć do Chin. W 1552 zszedł z pokładu portugalskiego statku na wyspę Shangchuan, u wybrzeży Chin, gdzie ciężko chory zmarł. Według przekazów porzucony na wybrzeżu przez dwanaście dni samotnie zmagał się z gorączką. Został pochowany w Goa, w kościele jezuickim.