Wczesne życie Milligan urodził się jako William Stanley Morrison 14 lutego 1955 roku w Miami Beach jako syn Dorothy Pauline Sands i Johnny’ego Morrisona.

Dorothy wychowała się na wsi w stanie Ohio i mieszkała w Lancaster ze swoim pierwszym mężem. Po rozwodzie Dorothy przeniosła się w okolice Miami, gdzie pracowała jako piosenkarka. Tam zamieszkała z Johnnym Morrisonem. Para miała dwoje innych dzieci: syna Jima, urodzonego w październiku 1953 roku, oraz córkę Kathy Jo, urodzoną w grudniu 1956 roku.

Johnny Morrison miał trudności z ojcostwem, a według Keyesa „Koszty leczenia przytłaczały Johnny’ego. Pożyczał więcej, więcej grał i więcej pił... W 1958 roku trafił do szpitala z powodu ostrego alkoholizmu i depresji”. Wydarzyła się także próba samobójcza – według Keyesa: „Dorothy znalazła go pochylonego nad stołem, z butelką whisky i pustą butelką po tabletkach nasennych na podłodze”. Kilka miesięcy później, 17 stycznia 1959 roku, Johnny popełnił samobójstwo poprzez zatrucie tlenkiem węglaKeyes, Daniel (1981). Człowiek o 24 twarzach, Random House, s. 131–135. .