Abetz szczególną uwagę zwrócił na rozwiązanie kwestii żydowskiej, odgrywając najpierw ważną rolę w deportacjach zagranicznych Żydów mieszkających we Francji, a następnie także etnicznych Żydów francuskich (zwłaszcza po listopadzie 1942 i wprowadzeniu okupacji niemieckiej także na południu Francji). Ponosi także odpowiedzialność za deportacje robotników przymusowych do Rzeszy.
Został aresztowany po wyzwoleniu Francji spod hitlerowskiej okupacji i postawiony przed Trybunałem Wojskowym. W 1949 Abetz skazany został za zbrodnie wojenne na karę 20 lat ciężkich robót. Uniewinniony został natomiast od zarzutu udziału w zabójstwie byłego ministra spraw wewnętrznych Francji Georges’a Mandla. W 1954, po odsiedzeniu 5 lat wyroku, został zwolniony i powrócił do RFN. Otto Abetz zginął w wypadku samochodowym w 1958 na autostradzie Kolonia-Düsseldorf.
Odznaczenia Krzyż Zasługi Wojennej I i II klasy Medal Pamiątkowy 1 października 1938 z okuciem Zamek Praga Odznaka Honorowa Olimpijska Krzyż Komandorski Orderu Świętych Maurycego i Łazarza