Mimo wyraźnych podobieństw do innych instrumentów wcześniej i współcześnie wytwarzanych Trautonium posiadał pewne cechy wyróżniające je spośród innych. Była to możliwość bardziej swobodnego kształtowania dźwięku. Instrument posiadał dodatkowe oscylatory, kontrolowane szeregiem przełączników i pokręteł, wzbogacające brzmienie o dodatkowe składowe harmoniczne oraz szereg filtrów dodatkowo kształtujących falę. Brzmienie Trautonium dzięki temu było dużo bogatsze od wszelkich innych instrumentów tamtych czasów tak, że może być uznane za prekursora współczesnych syntezatorów.
W późniejszych latach powstały zmodyfikowane wersje instrumentów: Mixture Trautonium – oparte na technologii półprzewodnikowej oraz z tak dobraną charakterystyką opornik, że była ona liniowa, a nie wykładnicza jak w innych modelach. Radio Trautonium – wersja bez wzmacniacza, przeznaczona do bezpośrednich transmisji radiowych Trautonium koncertowe – ze wzmacniaczem o większej mocy i rozwiniętym zestawem głośników.
Instrument ten znalazł zastosowanie w praktyce muzycznej.