539 (DXXXIX) година е обикновена година, започваща в събота.
Събития Март – готите и бургундите си връщат Медиоланум (модерно Милано), след много месеци на обсада, градът достига точката на гладна смърт. Византийският гарнизон (1000 души) се предава и е пощаден, но жителите са избити (според Прокопий Кесарийски 300 000 души са убити), а самият град е разрушен. Велизарий, който все още обсажда Равена, преговаря за договор с Теодеберт I (чиито сили страдат от дизентерия). Франките се оттеглят в Галия. Византийската флота контролира Адриатическо море и блокира пристанището на столицата от доставки. Император Юстиниан I е разтревожен от подновените варварски набези през дунавската граница от страна на славяните, българите, гепидите и аварите. Валтари убива чичо си Вачо и става крал на лангобардите. Кинмей наследява своя брат Сенка и се възкачва като 29-ия император на трона на Япония. Четвърта година на световен глад, вследствие на климатични аномалии от 535 – 536 г. 29 ноември – Антиохия е ударена от земетресение.
Родени Абу Талиб ибн Абд ал-Муталиб, водач на Бану Хашим и чичо на Мохамед († 619 г.) Берта, съпруга на Етелберт от Кент Хилперик I, крал на Неустрия (приблизителна дата) Маврикий, император на Византийската империя († 602 г.)
Починали Сенка, император на Япония Уачо, крал на лангобардите