Rastvorni nosači (SLC) su grupa membranskih transportnih proteina koja uključuje preko 400 članova, organiziranih u 66 porodica. Većina članova SLC grupe nalazi se u ćelijskoj membrani. Sistem genske nomenklature SLC izvorno je predložio HUGO-ov Odbor za gensku nomenklaturu (HGNC) i osnova je za službena HGNC imena gena koji kodiraju ove transportere. Općenitija klasifikacija transmembranskih transportera može se naći u TCDB bazi podataka.

Otopljene tvari koje transportiraju različiti članovi SLC grupe izuzetno su raznolike i uključuju napunjene i nenabijene organske molekule, kao i anorganske ione i transporter plina amonijaka.

Kao što je uobučajeno za integralni membranski protein, SLC sadrže niz hidrofobnih [transmembranskih alfa-heliksa međusobno povezanih hidrofilnim unutar- i vanćelijskim petljama. Ovisno o SLC, ovi transporteri su funkcionalni ili kao monomeri ili kao obvezni homo- ili heterooligomeri. Mnoge porodice SLC-a članovi su glavne natporodice olakšivača.

Opseg Prema odgovarajućoj konvenciji sistema nomenklature, članovi unutar pojedine porodice SLC imaju međusobno više od 20-25% identitičnih sekvenci. Suprotno tome, homologija između porodica SLC je vrlo niska ili nikakva. Dakle, kriterij za uključivanje porodice u SLC grupu nije evolucijska povezanost s drugim porodicama SLC, već je funkcionalni (tj. Integralni membranski protein koji prenosi rastvorenu supstancu).

SLC grupa uključuje primjere transportnih proteina, kao štp su:

Olakšani transporteri (omogućavaju otopljenim supstancama da teku nizvodno sa svojim elektrohemijskim gradijentima) sekundarni aktivni transporteri (dopuštaju rastvorima da teku uzvodno prema njihovom elektrokemijskom gradijentu, spajanjem za transport druge otopljene supstance koje teku nizvodno svojim gradijentom tako da je ukupna promjena slobodne energije i dalje povoljna)

Serija SLC ne uključuje članove porodica transportnih proteina koji su prethodno klasificirani u drugim široko prihvaćenim sistemima nomenklature, uključujući:

primarni aktivni transporteri (omogućavaju protok uzbrdo prema elektrohemijskim gradijentima) kao što su ABC (ATP-vezna kaseta) transporteri spajanjem transporta do oslobađanja energije kao što je kao hidroliza ATP; ionski kanali akvaporini (vodeni kanali)

Subćelijska distribucija Većina članova grupe SLC nalazi se u ćelijskoj membrani, ali neki nalaze se u mitohondrijama (najznačajnija je porodica SLC 25) ili u drugim unutarćelijskim organelama.

Sistem nomenklature Imena pojedinačnih članova SLC-a imaju sljedeći format: SLCnXm gdje je: SLC korijen od (SoLute Carrier); n = cijeli broj koji predstavlja porodicu (npr., 1-52); X = jedno slovo (A, B, C, ...) koje označava podporodicu; m = cijeli broj koji predstavlja pojedinačnog člana porodice (izoforma).

Naprimjer, SLC1A1 je prva izoforma potporodice A SLC-porodice 1.

Izuzetak je kod porodice SLC 21 (transporteri organskih aniona koji transportuju polipeptide), koji iz povijesnih razloga imaju imena u formatu SLCOnXm gdje je n = broj porodice, X = slovo potporodice i m = broj člana.

Iako HGNC samo dodjeljuje nomenklaturu ljudskim genima, ortolozi kičmenjaka tih gena usvajaju istu nomenklaturu (npr. ortolozi dodijeljeni VGNC-assigned orthologs of SLC10A1). Za glodare se simboli razlikuju od ostalih kičmenjaka, upotrebom naslova, tj. Slc1a1 koji označava glodarskog orthologa ljudskog gena SLC1A1.

Porodice U SLC imenovane su sljedeće porodice: Glutamat sa visokim afinitetom i neutralni aminokiselinski transporteri; (SLC1A1, SLC1A2, SLC1A3, SLC1A4, SLC1A5, SLC1A6, SLC1A7) olakšavajući GLUT transporter (SLC2A1, SLC2A2, SLC2A3, SLC2A4, SLC2A5, SLC2A6, SLC2A7, SLC2A8, SLC2A9, SLC2A10, SLC2A11, SLC2A12, SLC2A13, SLC2A14) teške podjedinice heterodimernih transportera aminokiselina (SLC3A1, SLC3A2) bikarbonatni transporter (SLC4A1, SLC4A2, SLC4A3, SLC4A4, SLC4A5, SLC4A6, SLC4A7, SLC4A8, SLC4A9, SLC4A10, SLC4A11) kotransporter natrij-glukoze (SLC5A1, SLC5A2, SLC5A3, SLC5A4, SLC5A5, SLC5A6, SLC5A7, SLC5A8, SLC5A9, SLC5A10, SLC5A11, SLC5A12) natrij- i hlorid-zavisni natrij: neurotransmiterski simporteri (SLC6A1, SLC6A2, SLC6A3, SLC6A4, SLC6A5, SLC6A6, SLC6A7, SLC6A8, SLC6A9, SLC6A10, SLC6A11, SLC6A12, SLC6A13, SLC6A14, SLC6A15, SLC6A16, SLC6A17, SLC6A18, SLC6A19, SLC6A20) kationski aminokiselinski transporter/povezan sa glikoproteinom cationic amino acid transporters (SLC7A1, SLC7A2, SLC7A3, SLC7A4) glikoprotein-vezani/lahka ili katalitska podjedinica transporteri heterodimernih aminokiselina (SLC7A5, SLC7A6, SLC7A7, SLC7A8, SLC7A9, SLC7A10, SLC7A11, SLC7A13, SLC7A14) izmjenjivači Na+/Ca2+ (SLC8A1, SLC8A2, SLC8A3) izmjenjivač Na+/H+ (SLC9A1, SLC9A2, SLC9A3, SLC9A4, SLC9A5, SLC9A6, SLC9A7, SLC9A8, SLC9A9, SLC9A10, SLC9A11, SLC9B1, SLC9B2) kotransporter natrijeve žučne soli (SLC10A1, SLC10A2, SLC10A3, SLC10A4, SLC10A5, SLC10A6, SLC10A7) protonski spregnuti metalni ionski transporter (SLC11A1, SLC11A2) kotransporter elektroneutralnog kationa-Cl (SLC12A1, SLC12A1, SLC12A2, SLC12A3, SLC12A4, SLC12A5, SLC12A6, SLC12A7, SLC12A8, SLC12A9) Kotransporter Na+-sulfat/karboksilata (SLC13A1, SLC13A2, SLC13A3, SLC13A4, SLC13A5) urea transporter (SLC14A1, SLC14A2) protonski oligopeptidni kotransporter (SLC15A1, SLC15A2, SLC15A3, SLC15A4) monokarboksilatni transporter (SLC16A1, SLC16A2, SLC16A3, SLC16A4, SLC16A5, SLC16A6, SLC16A7, SLC16A8, SLC16A9, SLC16A10, SLC16A11, SLC16A12, SLC16A13, SLC16A14) vezikulski glutamatni transporter (SLC17A1, SLC17A2, SLC17A3, SLC17A4, SLC17A5, SLC17A6, SLC17A7, SLC17A8, SLC17A9) vezikulski aminski transporter (SLC18A1, SLC18A2, SLC18A3) folate/thiamine transporter (SLC19A1, SLC19A2, SLC19A3) kotransporter tipa III Na+-fosfata (SLC20A1, SLC20A2) organsko anionsko transportiranje potporodica 1 (SLCO1A2, SLCO1B1, SLCO1B3, SLCO1C1) potporodica 2 (SLCO2A1, SLCO2B1) potporodica 3 (SLCO3A1) potporodica 4 (SLCO4A1, SLCO4C1) potporodica 5 (SLCO5A1) potporodica 6 (SLCO6A1) organski kation / anion /blizni transporter (SLC22A1, SLC22A2, SLC22A3, SLC22A4, SLC22A5, SLC22A6, SLC22A7, SLC22A8, SLC22A9, SLC22A10, SLC22A11, SLC22A12, SLC22A13, SLC22A14, SLC22A15, SLC22A16, SLC22A17, SLC22A18, SLC22A18AS, SLC22A19, SLC22A20, SLC22A23, SLC22A24, SLC22A25, SLC22A31) transporter Na+-zavisne askorbinske kiseline (SLC23A1, SLC23A2, SLC23A3, SLC23A4) izmjenjivač Na+/(Ca2+-K+) (SLC24A1, SLC24A2, SLC24A3, SLC24A4, SLC24A5, SLC24A6) mitohondrijski nosač (SLC25A1, SLC25A2, SLC25A3, SLC25A4, SLC25A5, SLC25A6, UCP1(SLC25A7), UCP2(SLC25A8), UCP3(SLC25A9), SLC25A10, SLC25A11, SLC25A12, SLC25A13, SLC25A14, SLC25A15, SLC25A16, SLC25A17, SLC25A18, SLC25A19, SLC25A20, SLC25A21, SLC25A22, SLC25A23, SLC25A24, SLC25A25, SLC25A26, SLC25A27, SLC25A28, SLC25A29, SLC25A30, SLC25A31, SLC25A32, SLC25A33, SLC25A34, SLC25A35, SLC25A36, SLC25A37, SLC25A38, SLC25A39, SLC25A40, SLC25A41, SLC25A42, SLC25A43, SLC25A44, SLC25A45, SLC25A46), SLC25A47, SLC25A48, MTCH1(SLC25A49), MTCH2(SLC25A50), SLC25A51, SLC25A52, SLC25A53 višenamjenski izmjenjivač aniona (SLC26A1, SLC26A2, SLC26A3, SLC26A4, SLC26A5, SLC26A6, SLC26A7, SLC26A8, SLC26A9, SLC26A10, SLC26A11) proteini transporta masnih kiselina (SLC27A1, SLC27A2, SLC27A3, SLC27A4, SLC27A5, SLC27A6) Na+-spregnuti nukleozidni transport (SLC28A1, SLC28A2, SLC28A3) olakšavajući nukleozidni transporter (SLC29A1, SLC29A2, SLC29A3, SLC29A4) transporter cinka (SLC30A1, SLC30A2, SLC30A3, SLC30A4, SLC30A5, SLC30A6, SLC30A7, SLC30A8, SLC30A9, SLC30A10) transporter bakra (SLC31A1, SLC31A2) vezikulski inhibitorni transporter aminokiseline (SLC32A1) transporter Acetil-CoA (SLC33A1) kotransportere tipa II Na+-fosfata (SLC34A1, SLC34A2, SLC34A3) nukleotidno-šečerni transporter potporodica A (SLC35A1, SLC35A2, SLC35A3, SLC35A4, SLC35A5) potporodica B (SLC35B1, SLC35B2, SLC35B3, SLC35B4) potporodica C (SLC35C1, SLC35C2) potporodica D (SLC35D1, SLC35D2, SLC35D3) potporodica E (SLC35E1, SLC35E2A, SLC35E2B, SLC35E3, SLC35E4) potporodica F (SLC35F1, SLC35F2, SLC35F3, SLC35F4, SLC35F5) potporodica G (SLC35G1, SLC35G3, SLC35G4, SLC35G5, SLC35G6) transporter proton-spregnute aminokiseline (SLC36A1, SLC36A2, SLC36A3, SLC36A4) izmjenjivač šećer-fosfat/fosfat (SLC37A1, SLC37A2, SLC37A3, SLC37A4) transporterski sistem A & N, natrij-spregnute aminokiseline (SLC38A1, SLC38A2, SLC38A3, SLC38A4, SLC38A5, SLC38A6, SLC38A7, SLC38A8, SLC38A9, SLC38A10, SLC38A11) transporter metalnih iona (SLC39A1, SLC39A2, SLC39A3, SLC39A4, SLC39A5, SLC39A6, SLC39A7, SLC39A8, SLC39A9, SLC39A10, SLC39A11, SLC39A12, SLC39A13, SLC39A14) transporter bazolateralnog gvožđa (SLC40A1) MgtE-liiki transporter magnezija (SLC41A1, SLC41A2, SLC41A3) transporter smonijaka (RHAG(SLC42A1), RHBG(SLC42A2), RHCG(SLC42A3)) Na+-nezavisni, sistem-L sličan transporteru aminokiseline (SLC43A1, SLC43A2, SLC43A3) holinoliki transporter (SLC44A1, SLC44A2, SLC44A3, SLC44A4, SLC44A5) pretpostavljeni šećerni transporter (SLC45A1, SLC45A2, SLC45A3, SLC45A4) Folatni transporter (SLC46A1, SLC46A2, SLC46A3) multidrug and toxin extrusion (SLC47A1, SLC47A2) porodica hemskog transportera (SLC48A1) Hemski transporter (FLVCR1(SLC49A1), FLVCR2(SLC49A2), SLC49A3, SLC49A4) transporteri izlaza šećera porodice SWEET (SLC50A1) Transporteri steroid-izvedenih molekula (SLC51A, SLC51B) Riboflavinska transporterska porodica RFVT/SLC52 (SLC52A1, SLC52A2, SLC52A3) fosfatni nosači (XPR1(SLC53A1) Mitohondrijski piruvatni nosači (MPC1(SLC54A1), MPC2(SLC54A2), MPC1L(SLC54A3)) Mitochondrijski kation/proton izmjenjivači (LETM1(SLC54A1), LETM2(SLC54A2), LETMD1(SLC54A3)) Siderofleksini (SFXN1(SLC56A1), SFXN2(SLC56A2), SFXN3(SLC56A3), SFXN4(SLC56A4), SFXN5(SLC56A5)) porodica NiPA-likih transportera magnezija (NIPA1(SLC57A1), NIPA2(SLC57A2), NIPAL1(SLC57A3), NIPAL2(SLC57A4), NIPAL3(SLC57A5), NIPAL4(SLC57A6)) porodica MagT-likikih transportera magnezija (MAGT1(SLC58A1), TUSC3(SLC58A2)) porodica simportera natrij-zavisnog lizofosfatidilholina (MFSD2A(SLC59A1), MFSD2B(SLC59A2)) transporteri glucoze (MFSD4A(SLC60A1), MFSD4B(SLC60A2)) porodica molibdatnih transportea (MFSD5(SLC61A1)) Pirofosfatni transporteri (ANKH(SLC62A1)) Sfingozin-fosfatni transporteri (SPNS1(SLC63A1), SPNS2(SLC63A2), SPNS3(SLC63A3)) Golgijevi Ca2+/H+ izmjenjivači (TMEM165(SLC64A1)) NPC-tip holesterolskih transportera (NPC1(SLC65A1), NPC1L1(SLC65A2)) Kationaki aminokiselinski eksporteri (SLC66A1, SLC66A2, SLC66A3, CTNS(SLC66A4), MPDU(SLC66A5))

Pretpostavljeni SLC Pretpostavljeni SLC, koji se nazivaju i atipski SLC, novi su, vjerovatno vjerodostojni sekundarno aktivni ili olakšavajući proteini-transporteri koji dijele porijeklo predaka sa poznatim SLC-ima. Ovi SLC-ovi tipa MFS mogu se, međutim, podijeliti na 15 porodica olakšavajućih MFS iransportera (AMTF).

Svi pretpostavljeni SLC su prihvatljivi SLC-transporteri. Neki su samo "netipski" kada je u pitanju njihova nomenklatura; geni imaju SLC oznaku, ali kao zamjensko ime, i zadržali su svoj ranije dodijeljeni simbol gena "ne-SLC" kao odobreni simbol.

Evo nekoliko navedenih pretpostavljenih SLC-a: OCA2, CLN3, TMEM104, SPNS1, SPNS2, SPNS3, SV2A, SV2B, SV2C, SVOP, SVOPL, MFSD1, MFSD2A, MFSD2B, MFSD3, MFSD4A, MFSD4B, MFSD5, MFSD6, MFSD6L, MFSD8, MFSD9, MFSD10, MFSD11, MFSD12, MFSD13A, MFSD14A, MFSD14B, UNC93A and UNC93B1.

Reference

SLC Tables. SLCtables

Vanjski linkovi Outline of families Datasets and Reagents on the Solute Carrier Family List of proteins at HGNC website

Kategorija:Proteinske porodice Kategorija:Transportni proteini Kategorija:Transmembranski proteini Kategorija:Proteini