RPA-interaktivni protein je protein koji je kod ljudi kodiran genom that in RPAIN.
Dužina polipeptidnog lanca je 219 aminokiselina, a molekulska težina 24.784.
Aminokiselinska sekvenca Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MAESLRSPRRSLYKLVGSPPWKEAFRQRCLERMRNSRDRLLNRYRQAGSS GPGNSQNSFLVQEVMEEEWNALQSVENCPEDLAQLEELIDMAVLEEIQQE LIKQEQSIISEYEKSLQFDEKCLSIMLAEWEANPLICPVCTKYNLRITSG VVVCQCGLSIPSHSSELTEQKLRACLEGSINEHSAHCPHTPEFSVTGGTE EKSSLLMSCLACDTWAVIL
Kloniranje i ekspresija Pregledom biblioteke cDNK ljudskog fetusog mozga, Chen et al. (2005) klonirali su devet prerađenih varijanti RPAIN-a, koje su nazvali RIP. Izvedeni protein sa 219 aminokiselina pune dužine ima N-terminalnu regiju baza bogatu argininom, a slijedi ga kiselo područje jedra i dva C-terminalna domena nalik na cinkov prst. U nekoliko ostalih RPAIN izoformi nedostaje jedan ili oba C-terminalna domena, slična cinkovom prstu. RPAIN je visoko konzerviran kod eukariota, s ortolozima kod pacova, miša i Xenopus laevis. PCR analiza više tkiva cDNK pokazala je ekspresiju iRNK RPAIN-a u svim testiranim ljudskim tkivima. RPAIN označen fluorescencijom in situ lokalizovan na iedrima u ćelijama HEK293.
Chen et al. (2005) utvrdili su da gen RPAIN sadrži najmanje sedam egzona.Chen, J.-Z., Huang, S.-D., Ji, C.-N., Pang, R.-Y., Xie, Y., Xue, J.-L. Identification, expression pattern, and subcellular location of human RIP isoforms. DNA Cell Biol. 24: 464-469, 2005. [PubMed]: 16008515
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika