Protein 55 vezan za domen upredene zavojnice je protein koji je kod ljudi kodiran genom CCDC55. NSRP1 je atipski član porodice spojnih regulatornih proteina koji sadrže regije bogate argininom i serinom (RS). Članovi ove porodice imaju tendenciju da promoviraju uključivanje egzona u iRNK (Kim et al., 2011). Dužina polipeptidnog lanca je 558 aminokiselina, a molekulska težina 66.390 Da..

Aminokiselinska sekvenca Simboli

C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin

1020304050 MAIPGRQYGLILPKKTQQLHPVLQKPSVFGNDSDDDDETSVSESLQREAA KKQAMKQTKLEIQKALAEDATVYEYDSIYDEMQKKKEENNPKLLLGKDRK PKYIHNLLKAVEIRKKEQEKRMEKKIQREREMEKGEFDDKEAFVTSAYKK KLQERAEEEEREKRAAALEACLDVTKQKDLSGFYRHLLNQAVGEEEVPKC SFREARSGIKEEKSRGFSNEVSSKNRIPQEKCILQTDVKVEENPDADSDF DAKSSADDEIEETRVNCRREKVIETPENDFKHHRSQNHSRSPSEERGHST RHHTKGSRTSRGHEKREDQHQQKQSRDQENHYTDRDYRKERDSHRHREAS HRDSHWKRHEQEDKPRARDQRERSDRVWKREKDREKYSQREQERDRQQND QNRPSEKGEKEEKSKAKEEHMKVRKERYENNDKYRDREKREVGVQSSERN QDRKESSPNSRAKDKFLDQERSNKMRNMAKDKERNQEKPSNSESSLGAKH RLTEEGQEKGKEQERPPEAVSKFAKRNNEETVMSARDRYLARQMARVNAK TYIEKEDD NSRP1 je atipski član porodice spojnih regulatornih proteina koji sadrže regije bogate argininom i serinom (RS). Članovi ove porodice imaju tendenciju da promoviraju uključivanje egzona u iRNK (Kim et al., 2011). Kloniranje i ekspresija Kim et al. (2011) izvijestili su da izvedeni ljudski protein NSRP1 od 558 aminokiselina, koji su označili kao NSRP70, ima N-terminalni motiv prepoznavanja RNK (RRM), a zatim domen sa upredenom zavojnicom, drugi RRM domen, sličan RS-u regiji, drugog domena zavojnica i netipski signal jedarne lokalizacije u blizini C-kraj. Northern blot analiza otkrila je varijabilnu ekspresiju Nsrp70 u tkivima miša, s najvećom ekspresijom u sjemenicima, praćenom slezenom i bubrezima, a najmanjom u mišićima, timusu i jetri. Analiza baze podataka otkrila je široko rasprostranjenu ljudsku ekspresiju NSRP70, sa izraženom ekspresijom u nekoliko limfoidnih organa i ćelija. NSRP70 označen fluorescencijom eksprimiran je u jedrima transficiranih COS-7 ćelija, gdje je kolokaliziran sa SC35 (SRSF2) u jedarnim strukturama. Analiza baze podataka otkrila je ortologe NSRP70 kod kičmenjaka, voćnih mušica i oblih glista. Hartz (2015) je gen mapirala je gen u hromosomu 17, sekvenca q11.2, na osnovu poravnanja sekvence NSRP1 (GenBank AL136806) sa genomskom sekvencom (GRCh38).

Kim et al (2011) izvijestili su da se mišji Nsrp1 malazi na hromosomu 11. Koristeći in vivo testove spajanja, Kim et al. (2011) otkrili su da je NSRP70 povećao uključivanje alternativno prerađenih egzona u tri testna minigena. Analiza delecije otkrila je da je lokalizacija NSRP70 u jedru potrebna za alternativnom preradom posredovano NSRP70 i da je prvi udomen uoredene zavojnice NSRP70 kritičan za katalitsku aktivnost. NSRP70 je komunicirao sa SC35 i ASF (SRSF1) putem svoje domene nalik RS-u na C-terminalu. Katalitički neaktivni NSRP70 je također komunicirao sa SC35 i ASF

Kim et al. (2011) otkrili su da je homozigotna delecija gena Nsrp70 kod miša bila smrtonosna za mbrion ubrzo nakon implantacije.Kim, Y.-D., Lee, J.-Y., Oh, K.-M., Araki, M., Araki, K., Yamamura, K., Jun, C.-D. NSrp70 is a novel nuclear speckle-related protein that modulates alternative pre-mRNA splicing in vivo. Nucleic Acids Res. 39: 4300-4314, 2011. PubMed: 21296756

Reference

Vanjski linkovi

Dopunska literatura

Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika