CKLF-oliki MARVEL-ski protein 2 sa transmembranskim domenom je protein koji je kod ljudi kodiran genom CMTM2.
Ovaj gen pripada superporodici gena hemokinolikih faktora, novoj porodici koja povezuje hemokine i superporodice transmembranskih proteina 4 superfamilija, superporodice signalizacijskih molekula. Protein koji kodira ovaj gen može imati važnu ulogu u razvoju sjemenika.
Članovi superporodice hemokinolikih protrina, uključujući CKLFSF2, slični su sa hemokinima i transmembranskim proteinom 4 superporodice signalnih molekula.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 248 aminokiselina, a molekulska težina 27.496 Da.. 1020304050 MAPKAAKGAKPEPAPAPPPPGAKPEEDKKDGKEPSDKPQKAVQDHKEPSD KPQKAVQPKHEVGTRRGCRRYRWELKDSNKEFWLLGHAEIKIRSLGCLIA AMILLSSLTVHPILRLIITMEISFFSFFILLYSFAIHRYIPFILWPISDL FNDLIACAFLVGAVVFAVRSRRSMNLHYLLAVILIGAAGVFAFIDVCLQR NHFRGKKAKKHMLVPPPGKEKGPQQGKGPEPAKPPEPGKPPGPAKGKK Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Pregledom baza podataka za sekvence homologa s hemokinolikim faktorom (CKLF), a zatim i RT-PCR biblioteke cDNK sjemenika, Han et al. (2003) klonirali su CKLFSF2. Izvedeni protein od 248 aminokiselina sadrži četiri transmembranska segmenta. CKLFSF2 ima najbližu sličnost sa CKLF, CKLFSF1 i CKLFSF7. Northern blot analizom otkriven je transkript od 1,07 kb, koji je bio visoko eksprimiran u sjemenicima. Nije otkrivena ekspresija u leukocitima i placenti. Također su klonirali dva mišja ortologa CKLFSF2, koje su označili kao Cklfsf2a i Cklfsf2b. Mišji proteini imaju približno 46%, odnosno 48% sličnosti sekvenci sa CKLFSF2.
Mapiranje Analizom genomske sekvence, Han et al. (2003) mapirali su gen CKLFSF2 u hromosomu 16, sekvenca 16q22, gdje se nalazi u uskom klasteru gena s genima CKLF, CKLFSF1, CKLFSF3 i CKLFSF4. Gene Cklfsf2a i Cklfsf2b mapirali su u hromosom 8, gdje su ugrađeni u sličan genski klasteriHan, W., Ding, P., Xu, M., Wang, L., Rui, M., Shi, S., Liu, Y., Zheng, Y., Chen, Y., Yang, T., Ma, D. Identification of eight genes encoding chemokine-like factor superfamily members 1-8 (CKLFSF1-8) by in silico cloning and experimental validation. Genomics 81: 609-617, 2003. PubMed: 12782130 Članovi superporodice hemokinolikih roteina, uključujući CKLFSF2, slični su hemokinima i transmembranskom proteinu 4 superporodice signalnih molekula.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika