SHCBP1

SHC SH2 domen-vezujuči protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom SHCBP1.

Međunarodni konzorcij za radijacijsko hibridno mapiranje lociralo je je gen SHCBP1 na hromosom 16 (RH78742).

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 673 aminokiseline, a molekulska težina 75.690 Da.

1020304050 MADGSLTGGGLEAAAMAPERMGWAVEQELASLEKGLFQDEDSCSDCSYRD KPGSSLQSFMPEGKTFFPEIFQTNQLLFYERFRAYQDYILADCKASEVQE FTAEFLEKVLEPSGWRAVWHTNVFKVLVEITDVDFAALKAVVRLAEPYLC DSQVSTFTMECMKELLDLKEHRLPLQELWVVFDDSGVFDQTALAIEHVRF FYQNIWRSWDEEEEDEYDYFVRCVEPRLRLHYDILEDRVPSGLIVDYHNL LSQCEESYRKFLNLRSSLSNCNSDSEQENISMVEGLKLYSEMEQLKQKLK LIENPLLRYVFGYQKNSNIQAKGVRSSGQKITHVVSSTMMAGLLRSLLTD RLCQEPGEEEREIQFHSDPLSAINACFEGDTVIVCPGHYVVHGTFSIADS IELEGYGLPDDIVIEKRGKGDTFVDCTGADIKISGIKFVQHDAVEGILIV HRGKTTLENCVLQCETTGVTVRTSAEFLMKNSDLYGAKGAGIEIYPGSQC TLSDNGIHHCKEGILIKDFLDEHYDIPKISMVNNIIHNNEGYGVVLVKPT IFSDLQENAEDGTEENKALKIQTSGEPDVAERVDLEELIECATGKMELCA RTDPSEQVEGNCEIVNELIAASTQKGQIKKKRLSELGITQADDNLMSQEM FVGIVGNQFKWNGKGSFGTFLF

Simboli

C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin

Funkcija gena Studijama koimunoprecipitacije na mišjima Shcbp1 i Shc, Schmandt et al. (1999) pokazali su da se Shcbp1 povezuje s izoformama p52 i p46 Shc. Studije padavina pokazale su da je povezanost Shcbp1 i Shc posredovana preko SH2 domena Shc i da je ta interakcija neovisna od fosforilacije tirozina.Schmandt, R., Liu, S. K., McGlade, C. J. Cloning and characterization of mPAL, a novel Shc SH2 domain-binding protein expressed in proliferating cells. Oncogene 18: 1867-1879, 1999. [ PubMed: 10086341

Kloniranje i ekspresija 2-hibridnim skriningom kvačeve biblioteka mišjih T-ćelija i embrionske cDNK s p52 SHC (SHC1) kao sondom, Schmandt et al. (1999) klonirali su Shcbp1, koji su nazvali Pal. Izvedeni mišji protein od 668 aminokiselina ima predviđenu molekulskuu masu od 75 kD i sadrži 23 ostatka tirozina, od kojih se nekoliko nalazi u motivima dobrog konsenzusa za domene SH2. Izolirali su ljudski SHCBP1, koji dijeli 78,2% aminokiselinskog identiteta sa svojim mišjim homologom. Northern blot analizom mišjih tkiva otkrivena je snažna ekspresija u sjemenicima i niža ekspresija u slezeni, plućima i srcu. Ekspresija iRNK Shcbp1 uočena je u mišićima u svim fazama razvoja embriona, a ekspresija iRNK Shcbp1 i proteina ograničena je na tkiva koja sadrže aktivno dijeleće ćelije i proliferirajuće ćelije u kulturi

Interakcije

Dokazano je da SHCBP1 ima interakcije sa SHC1.

Reference

Dopunska literatura

Kategorija:Geni na hromosomu 16 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika