Član A porodice sa sličnošću sekvence 181 je protein koji je kod ljudi kodiran genom FAM181A.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 354 aminokiseline, a molekulska težina 38.724 Da..
Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MPLEERRSSGERNDAAPTNHRRPGEKRASTAKQVSSVPFLGAAGHQQSLP SSWKASCSGPLVMASDSDVKMLLNFVNLASSDIKAALDKSAPCRRSVDHR KYLQKQLKRFSQKYSRLPRGLPGRAAEPYLKRGSEDRPRRLLLDLGPDSS PGGGGGCKEKVLRNPYREECLAKEQLPQRQHPEAAQPGQVPMRKRQLPAS FWEEPRPTHSYHVGLEGGLGPREGPPYEGKKNCKGLEPLGPETTLVSMSP RALAEKEPLKMPGVSLVGRVNAWSCCPFQYHGQPIYPGPLGALPQSPVPS LGLWRKSPAFPGELAHLCKDVDGLGQKVCRPVVLKPIPTKPAVPPPIFNV FGYL
Funkcija Analizirajući 1,780.295 5-krajnih sekvenci ljudskih cDNK punih dužina, izvedenih iz 164 tipa oligo-cap biblioteka cDNK, identificirano je 269.774 nezavisnih položaja transkripcijskih početnih mjesta (TSS) za 14.628 ljudskih RefSeq gena. Ovi TSS su grupirani u 30.964 klastera koji su međusobno odvojeni za više od 500 bp i stoga vrlo vjerojatno predstavljaju međusobno različite alternativne promotore. Najmanje 7674 (52%) ljudskih gena RefSeq podlijegalo je navodnim alternativnim promotorima (PAP). U prosjeku je bilo 3,1 PAP po genu, sa sastavom jednog promotora koji sadrži CpG-tok po 2,6 promotora bez CpG. U 17% lokusa koji sadrže PAP uočena je specifična upotreba PAP-ova za tkivo.
Najbogatiji izvori tkiva PAP-a specifičnih za tkivo bili su sjemenici i mozak. Također je bilo intrigantno da su promotori koji sadrže PAP obogaćeni genima koji kodiraju proteine povezane sa transdukcijom signala i da su rjeđi u genima koji kodiraju vanćelijske proteine, što možda odražava različite funkcionalne potrebe i ograničenu ekspresiju tih kategorija gena. Obrasci prvih egzona također su bili veoma raznoliki. U prosjeku je bilo 7,7 različitih tipov slternativne prerade prvih egzona po lokusu, koje su djelomično proizveli PAP-ovi, što sugerira da se ovim mehanizmom može postići širok spektar transkripata. Nalazi sugeriraju da bi upotreba alternativnih promotora i posljedična alternativna upotreba prvih egzona trebali imati ključnu ulogu u stvaranju složenosti potrebne za visoko razrađeni molekulski sistem kod ljudi.Kouichi Kimura, Ai Wakamatsu, Yutaka Suzuki, Toshio Ota, Tetsuo Nishikawa, Riu Yamashita, Jun-ichi Yamamoto, Mitsuo Sekine, Katsuki Tsuritani, Hiroyuki Wakaguri, Shizuko Ishii, Tomoyasu Sugiyama, Kaoru Saito, Yuko Isono, Ryotaro Irie, Norihiro Kushida, Takahiro Yoneyama, Rie Otsuka, Katsuhiro Kanda, Takahide Yokoi, Hiroshi Kondo, Masako Wagatsuma, Katsuji Murakawa, Shinichi Ishida, Tadashi Ishibashi, Asako Takahashi-Fujii, Tomoo Tanase, Keiichi Nagai, Hisashi Kikuchi, Kenta Nakai, Takao Isogai, Sumio Sugano (2006): Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes. Genome Res 16(1):55-65. doi:10.1101/gr.4039406; PMID 16344560
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika