Proteinoliki interferonski regulatorno vezujući faktor 2 ie protein koji je kod ljudi kodiran genom IRF2BPL.
Mutacije su mu povezane sa neurološkim problemima. Preciznije, mutacije ovog gena uzrokuju sindrom NEDAMSS, čija skraćenica znači NEurorazvojni poremećaj s regresijom, abnormalnim pokretima, gubitkom govora i napadima, prvi put opisanom u 2018.
Analizom genomske sekvence i radijacijso-hibridnim mapranjem , Rampazzo et al. (2000) locirali si gen C14ORF4 na hromosomskoj poziciji 14q24.3. Također su odredili da je ovaj gen bez introna. Bočno područje s 5' mjesta ne sadrži TATA ili CAATT okvire, ali ima puno GC sadržaja i uključuje dva mjesta koja vežu SP1. 3-bazni kraj sadrži dva signala poliadenilacije.Rampazzo, A., Pivotto, F., Occhi, G., Tiso, N., Bortoluzzi, S., Rowen, L., Hood, L., Nava, A., Danieli, G. A. Characterization of C14orf4, a novel intronless human gene containing a polyglutamine repeat, mapped to the ARVD1 critical region. Biochem. Biophys. Res. Commun. 278: 766-774, 2000. PubMed: 11095982
Molekuska genetika U sedam nepovezanih pacijenata s neurorazvojnim poremećajem s regresijom, abnormalnim pokretima, gubitkom govora i napadima (NEDAMSS), Marcogliese et al. (2018) identificirali su heterozigotne mutacije u genu IRF2BPL . Mutacije su pronađene sekvenciranjem egzona i potvrđene sangerovskim sekvenciranjem. Mutacije su se dogodile de novo kod svih pacijenata kod kojih je roditeljska DNK bila dostupna za analizu. Pet pacijenata nosilo je nonsens mutacije, dok su dva s nešto manje ozbiljnim fenotipom nosil misens mutacije. Prekomjerne ekspresija nonmsens mutacija kod drozofile nije izazvala smrtnost, kao što je uočeno kod prekomjerne ekspresije gena divljeg tipa, što sugerira da su nonsens mutacije rezultirale gubitkom funkcije. Ekspresija mutacije K418N rezultirala je smrtnošću pri višim temperaturama, što upućuje na to da uzrokuje djelomični gubitak funkcije, dok je ekspresija varijante P372R rezultirala smrtnošću, slično divljem tipu. Djelimično nokidiranje gena jama u Drosophila, korištenjem RNKi izazvalo je progresivni poremećaj nervne motorike i disfunkciju učenja, a specifično nokautiranje gena u fotoreceptorima oka uzrokovalo je progresivne abnormalnosti. Kompletni poremećaj gena drozofilskih jama bio je toksičan za mušicu, što je rezultiralo letalnošću, kao i prekomjerna ekspresija obje jame i IRF2BPL. Nalazi sugeriraju da je gen IRF2BPL uključen i u neurološki razvoj i u održavanje neurona.
Koristeći sekvenciranje egzoma, Tran Mau-Them et al. (2019) identificirali su različite de novo heterozigotne nonsens mutacije pomjeranja okvira u genu IRF2BPL kod 11 nepovezanih pacijenata s NEDAMSS-om. Sve mutacije izostale su iz baze podataka gnomAD i očekivalo se da kodiraju protein kojem nedostaje C-terminalni RING-prstni domen.Tran Mau-Them, F., Guibaud, L., Duplomb, L., Keren, B., Lindstrom, K., Marey, I., Mochel, F., van den Boogaard, M. J., Oegema, R., Nava, C., Masurel, A., Jouan, T., and 26 others. De novo truncating variants in the intronless IRF2BPL are responsible for developmental epileptic encephalopathy. Genet. Med. 21: 1008-1014, 2019. PubMed: 30166628
Životinjski model Marcogliese et al. (2018) otkrili su da je široko konzerviran najbliži ortolog genu IRF2BPL u Drosophila, zvani pits, uključujući i u nervni sistem. Ekspresija je otkrivena u različitim dijelovima mozga, uključujući ćelijsko tijelo, jedro i neuronske aksone. Prekid gena jama bio je toksičan za mušicu, što je rezultiralo smrtonosnošću, kao i prekomjerna ekspresija oba pits-a i IRF2BPL. Kod Drosophila, gen pits nalazi se na X hromosomu.Marcogliese, P. C., Shashi, V., Spillmann, R. C., Stong, N., Rosenfeld, J. A., Koenig, M. K., Martinez-Agosto, J. A., Herzog, M., Chen, A. H., Dickson, P. I., Lin, H. J., Vera, M. U., and 22 others. IRF2BPL is associated with neurological phenotypes. Am. J. Hum. Genet. 103: 245-260, 2018. Note: Erratum: Am. J. Hum. Genet. 103: 456 only, 2018. PubMed: 30057031
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 796 aminokiselina, a molekulska težina 82-659 Da..
1020304050 MSAAQVSSSRRQSCYLCDLPRMPWAMIWDFSEPVCRGCVNYEGADRIEFV IETARQLKRAHGCFQDGRSPGPPPPVGVKTVALSAKEAAAAAAAAAAAAA AAQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQLNHVDGSSKPAVLAAPSGLERYG LSAAAAAAAAAAAAVEQRSRFEYPPPPVSLGSSSHTARLPNGLGGPNGFP KPTPEEGPPELNRQSPNSSSAAASVASRRGTHGGLVTGLPNPGGGGGPQL TVPPNLLPQTLLNGPASAAVLPPPPPHALGSRGPPTPAPPGAPGGPACLG GTPGVSATSSSASSSTSSSVAEVGVGAGGKRPGSVSSTDQERELKEKQRN AEALAELSESLRNRAEEWASKPKMVRDTLLTLAGCTPYEVRFKKDHSLLG RVFAFDAVSKPGMDYELKLFIEYPTGSGNVYSSASGVAKQMYQDCMKDFG RGLSSGFKYLEYEKKHGSGDWRLLGDLLPEAVRFFKEGVPGADMLPQPYL DASCPMLPTALVSLSRAPSAPPGTGALPPAAPSGRGAAASLRKRKASPEP PDSAEGALKLGEEQQRQQWMANQSEALKLTMSAGGFAAPGHAAGGPPPPP PPLGPHSNRTTPPESAPQNGPSPMAALMSVADTLGTAHSPKDGSSVHSTT ASARRNSSSPVSPASVPGQRRLASRNGDLNLQVAPPPPSAHPGMDQVHPQ NIPDSPMANSGPLCCTICHERLEDTHFVQCPSVPSHKFCFPCSRESIKAQ GATGEVYCPSGEKCPLVGSNVPWAFMQGEIATILAGDVKVKKERDP Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Parent Group Europe http://irf2bpl.de
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika