YLP-motivni protein 1 je protein koji je kod ljudi kodiran genom YLPM1. Genski lokus YLP, nalazi se na dugom (q) kraku hromosoma 14, sekvenca 14q24.3.
Projekt Zbirka gena sisara (MGC) Nacionalnog instituta za zdravlje osmišljen je za generiranje i sekvenciranje javno dostupnog izvora cDNK koji sadrži potpuni otvoreni okvir čitanja (ORF) za svaki gen čovjeka i miša. Projekt je u početku koristio slučajnu strategiju za selekciju klonova iz velikog broja biblioteka cDNK iz različitih tkiva. Klonovi kandidati su izabrani na osnovu 5'-EST sekvenci, a zatim su potpuno sekvencirani do velike tačnosti i analizirani algoritmima razvijenim za ovaj projekt. Postoji više od 11.000 ljudskih i 10.000 mišjih gena, predstavljeno u MGC-u od najmanje jednog klona s punim ORF-om. Pristup nasumičnom selekcijom sada dostiže tačku zasićenja, a prijelaz na protokole usmjerene na nedostajuće transkripte, sada je potreban za kompletiranje zbirki miševa i ljudi. Usporedba sekvence MGC klonova sa referentnim sekvencama genoma otkriva da je većina klonova cDNK vrlo visokog kvaliteta sekvence, iako je vjerovatno da neke cDNK mogu nositi pogrešne varijante kao posljedicu eksperimentalnog artefakta, poput PCR-a, kloniranja ili greške obrnute transkripcije. Nedavno je projektu dodana komponenta pacovske cDNK, a tekući projekti cDNK žabe (ksenopusa) i ribe zebrica (rod Danio) prošireni su, kako bi se iskoristili prednosti visokopropusnog MGC kanala.Daniela S Gerhard et al. (2004): The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res, 14(10B):2121-7, doi: 10.1101/gr.2596504, pmid: 15489334, pmcid: pmc528928, doi: 10.1101/gr.2596504
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.951 aminokiselina, a molekulska težina 219 985 Da..
1020304050 MYPNWGRYGGSSHYPPPPVPPPPPVALPEASPGPGYSSSTTPAAPSSSGF MSFREQHLAQLQQLQQMHQKQMQCVLQPHHLPPPPLPPPPVMPGGGYGDW QPPPPPMPPPPGPALSYQKQQQYKHQMLHHQRDGPPGLVPMELESPPESP PVPPGSYMPPSQSYMPPPQPPPSYYPPTSSQPYLPPAQPSPSQSPPSQSY LAPTPSYSSSSSSSQSYLSHSQSYLPSSQASPSRPSQGHSKSQLLAPPPP SAPPGNKTTVQQEPLESGAKNKSTEQQQAAPEPDPSTMTPQEQQQYWYRQ HLLSLQQRTKVHLPGHKKGPVVAKDTPEPVKEEVTVPATSQVPESPSSEE PPLPPPNEEVPPPLPPEEPQSEDPEEDARLKQLQAAAAHWQQHQQHRVGF QYQGIMQKHTQLQQILQQYQQIIQPPPHIQATTPPPGIPPPGVPQGIPPQ LTAAPVPPASSSQSSQVPEKPRPALLPTPVSFGSAPPTTYHPPLQSAGPS EQVNSKAPLSKSALPYSSFSSDQGLGESSAAPSQPITAVKDMPVRSGGLL PDPPRSSYLESPRGPRFDGPRRFEDLGSRCEGPRPKGPRFEGNRPDGPRP RYEGHPAEGTKSKWGMIPRGPASQFYITPSTSLSPRQSGPQWKGPKPAFG QQHQQQPKSQAEPLSGNKEPLADTSSNQQKNFKMQSAAFSIAADVKDVKA AQSNENLSDSQQEPPKSEVSEGPVEPSNWDQNVQSMETQIDKAQAVTQPV PLANKPVPAQSTFPSKTGGMEGGTAVATSSLTADNDFKPVGIGLPHSENN QDKGLPRPDNRDNRLEGNRGNSSSYRGPGQSRMEDTRDKGLVNRGRGQAI SRGPGLVKQEDFRDKMMGRREDSREKMNRGEGSRDRGLVRPGSSREKVPG GLQGSQDRGAAGSRERGPPRRAGSQERGPLRRAGSRERIPPRRAGSRERG PPRGPGSRERGLGRSDFGRDRGPFRPEPGDGGEKMYPYHRDEPPRAPWNH GEERGHEEFPLDGRNAPMERERLDDWDRERYWRECERDYQDDTLELYNRE DRFSAPPSRSHDGDRRGPWWDDWERDQDMDEDYNREMERDMDRDVDRISR PMDMYDRSLDNEWDRDYGRPLDEQESQFRERDIPSLPPLPPLPPLPPLDR YRDDRWREERNREHGYDRDFRDRGELRIREYPERGDTWREKRDYVPDRMD WERERLSDRWYPSDVDRHSPMAEHMPSSHHSSEMMGSDASLDSDQGLGGV MVLSQRQHEIILKAAQELKMLREQKEQLQKMKDFGSEPQMADHLPPQESR LQNTSSRPGMYPPPGSYRPPPPMGKPPGSIVRPSAPPARSSVPVTRPPVP IPPPPPPPPLPPPPPVIKPQTSAVEQERWDEDSFYGLWDTNDEQGLNSEF KSETAAIPSAPVLPPPPVHSSIPPPGPVPMGMPPMSKPPPVQQTVDYGHG RDISTNKVEQIPYGERITLRPDPLPERSTFETEHAGQRDRYDRERDREPY FDRQSNVIADHRDFKRDRETHRDRDRDRGVIDYDRDRFDRERRPRDDRAQ SYRDKKDHSSSRRGGFDRPSYDRKSDRPVYEGPSMFGGERRTYPEERMPL PAPSLSHQPPPAPRVEKKPESKNVDDILKPPGRESRPERIVVIMRGLPGS GKTHVAKLIRDKEVEFGGPAPRVLSLDDYFITEVEKEEKDPDSGKKVKKK VMEYEYEAEMEETYRTSMFKTFKKTLDDGFFPFIILDAINDRVRHFDQFW SAAKTKGFEVYLAEMSADNQTCGKRNIHGRKLKEINKMADHWETAPRHMM RLDIRSLLQDAAIEEVEMEDFDANIEEQKEEKKDAEEEESELGYIPKSKW EMDTSEAKLDKLDGLRTGTKRKRDWEAIASRMEDYLQLPDDYDTRASEPG KKRVRWADLEEKKDADRKRAIGFVVGQTDWEKITDESGHLAEKALNRTKY I Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika