Protein 13 cinkovog prsta sa CCCH domenom je protein koji je kod ljudi kodiran genom ZC3H13, sa hromosoma 13, sekvenca q14:45,954.464 – 46,052,793 (prema NCBI) .
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.668 aminokiselina, a molekulska težina 196.635 Da..
1020304050 MSKIRRKVTVENTKTISDSTSRRPSVFERLGPSTGSTAETQCRNWLKTGN CLYGNTCRFVHGPSPRGKGYSSNYRRSPERPTGDLRERMKNKRQDVDTEP QKRNTEESSSPVRKESSRGRHREKEDIKITKERTPESEEENVEWETNRDD SDNGDINYDYVHELSLEMKRQKIQRELMKLEQENMEKREEIIIKKEVSPE VVRSKLSPSPSLRKSSKSPKRKSSPKSSSASKKDRKTSAVSSPLLDQQRN SKTNQSKKKGPRTPSPPPPIPEDIALGKKYKEKYKVKDRIEEKTRDGKDR GRDFERQREKRDKPRSTSPAGQHHSPISSRHHSSSSQSGSSIQRHSPSPR RKRTPSPSYQRTLTPPLRRSASPYPSHSLSSPQRKQSPPRHRSPMREKGR HDHERTSQSHDRRHERREDTRGKRDREKDSREEREYEQDQSSSRDHRDDR EPRDGRDRRDARDTRDRRELRDSRDMRDSREMRDYSRDTKESRDPRDSRS TRDAHDYRDREGRDTHRKEDTYPEESRSYGRNHLREESSRTEIRNESRNE SRSEIRNDRMGRSRGRVPELPEKGSRGSRGSQIDSHSSNSNYHDSWETRS SYPERDRYPERDNRDQARDSSFERRHGERDRRDNRERDQRPSSPIRHQGR NDELERDERREERRVDRVDDRRDERARERDRERERDRERERERERERDRE REKERELERERAREREREREKERDRERDRDRDHDRERERERERDREKERE REREERERERERERERERERERERERARERDKERERQRDWEDKDKGRDDR REKREEIREDRNPRDGHDERKSKKRYRNEGSPSPRQSPKRRREHSPDSDA YNSGDDKNEKHRLLSQVVRPQESRSLSPSHLTEDRQGRWKEEDRKPERKE SSRRYEEQELKEKVSSVDKQREQTEILESSRMRAQDIIGHHQSEDRETSD RAHDENKKKAKIQKKPIKKKKEDDVGIERGNIETTSEDGQVFSPKKGQKK KSIEKKRKKSKGDSDISDEEAAQQSKKKRGPRTPPITTKEELVEMCNGKN GILEDSQKKEDTAFSDWSDEDVPDRTEVTEAEHTATATTPGSTPSPLSSL LPPPPPVATATATTVPATLAATTAAAATSFSTSAITISTSATPTNTTNNT FANEDSHRKCHRTRVEKVETPHVTIEDAQHRKPMDQKRSSSLGSNRSNRS HTSGRLRSPSNDSAHRSGDDQSGRKRVLHSGSRDREKTKSLEITGERKSR IDQLKRGEPSRSTSSDRQDSRSHSSRRSSPESDRQVHSRSGSFDSRDRLQ ERDRYEHDRERERERRDTRQREWDRDADKDWPRNRDRDRLRERERERERD KRRDLDRERERLISDSVERDRDRDRDRTFESSQIESVKRCEAKLEGEHER DLESTSRDSLALDKERMDKDLGSVQGFEETNKSERTESLEGDDESKLDDA HSLGSGAGEGYEPISDDELDEILAGDAEKREDQQDEEKMPDPLDVIDVDW SGLMPKHPKEPREPGAALLKFTPGAVMLRVGISKKLAGSELFAKVKETCQ RLLEKPKDADNLFEHELGALNMAALLRKEERASLLSNLGPCCKALCFRRD SAIRKQLVKNEKGTIKQAYTSAPMVDNELLRLSLRLFKRKTTCHAPGHEK TEDNKLSQSSIQQELCVS Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Sekvenciranjem klonova dobijenih iz biblioteke cDNK ljudskog mozga frakcionirane veličine, Nagase et al. (1998) klonirali su ZC3H13, koji su označili kao KIAA0853. Izvedeni protein od 967 aminokiselina ima slabu homologiju s ljudskim trihohialinom (TCHH). RT-PCR ELISA testom otkrili je najjaču ekspresiju KIAA0853 u jetri, jajnicima i mozgu, zatim u bubrezima. Umjerena ekspresija otkrivena je u srcu, plućima, skeletnim mišićima, gušterači i sjemenicima.Nagase, T., Ishikawa, K., Suyama, M., Kikuno, R., Hirosawa, M., Miyajima, N., Tanaka, A., Kotani, H., Nomura, N., Oharo, O. Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 5: 355-364, 1998. PubMed: 10048485 Funkcija gena Koristeći masenu spektrometrijsku analizu za identifikaciju proteina koji su imunoprecipitirani sa WTAP iz endotelnih ćelija ljudske pupčane vene (HUVEC), Horiuchi et al. (2013) identificirali su proteinski kompleks, koji je uključivao KIAA0853, HAKAI (CBLL1), virilizer (KIAA1429), RBM15, BCLAF1 i THRAP3. WTAP kompleks lokaliziran na jedarnim pjegama HeLa ćelija i HUVEC-ovima, a eksperimenti umrežavanja pokazali su da je prolazno povezan s faktorima prerade. Nokauniranje bilo koje komponente WTAP kompleksa, uključujući KIAA0853, smanjilo je alternativnu preradu WTAP-a, što je rezultiralo povećanom proizvodnjom proteina pune dužine WTAP-a i smanjenom proliferacijom ćelija, sa zastojem ćelijskog ciklusa u fazi G2. Razgradnja BCLAF1 i THRAP3 smanjila je lokalizaciju jedarnih pjega drugih komponenti WTAP kompleksa.Horiuchi, K., Kawamura, T., Iwanari, H., Ohashi, R., Naito, M., Kodama, T., Hamakubo, T. Identification of Wilms' tumor 1-associating protein complex and its role in alternative splicing and the cell cycle. J. Biol. Chem. 288: 33292-33302, 2013. PubMed: 24100041
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 13 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika