Domen upredene zavojnice sa proteinom 90B, znan i kao CCDC90B, je protein koji je kodiran genom CCDC90B. Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 254 aminokiseline, a molekulska težina 29.506 Da..
1020304050 MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRPRGHFSPALRREFFTTTTKEGYDRRPVD ITPLEQRKLTFDTHALVQDLETHGFDKTQAETIVSALTALSNVSLDTIYK EMVTQAQQEITVQQLMAHLDAIRKDMVILEKSEFANLRAENEKMKIELDQ VKQQLMHETSRIRADNKLDINLERSRVTDMFTDQEKQLMETTTEFTKKDT QTKSIISETSNKIDAEIASLKTLMESNKLETIRYLAASVFTCLAIALGFY RFWK
Gen
Kod ljudi CCDC90B nalazi se na hromosomu 11. U susjedstvu su: PCF11, sisarski protein 2 kompleksa cijepanja pre-iRNK ANKRD42, protein ponovljanja ankirina, uključen u vezivanje iona kalcija BC070093 DLG2, član porodice gvanilat-kinaza (MAGUK) povezanih sa membranom
Protein
Struktura Ovaj protein karakterizira domen nepoznate funkcije, DUF1640. Ovaj domen je obilježje cijelog proteina, s izuzetkom prve 23 aminokiselinska ostatka – MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP – koji su mjesto ciljanja mitohondrija i cijepani.
Protein ima sedam predviđenih alfa-heliksa, karakteristiku proteina sa zavojnicom.
Predviđena obilježja
Molekulska: 26,72 kDa
Izoelektrična tačka: 7.5
Transmembranski šaperoni: Nema
Posttranslacijske modifikacije: Hloroplastni tranzitni peptidi: Nema Signalni peptisdi: Nema C-manozulacijska mjesta: Nema N-glikozilacijska mjesta: Nema Mitohondrijski ciljanje: Da Mjesto cijepanja: MNSRQAWRLFLSQGRGDRWVSRP
Ćelijska lokacija
CCDC90B je vjerojatno mitohondrijski protein. Predviđa se da sadrži najmanje tri specifična mjesta fosforilacija: mjesta fosforilacije protein-kinaze C, mjesta fosforilacije kazein-kinaze II i mjesta ovisna o fosforilaciji ovisnoj o cAMP/cGMP.
Reference
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 11 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika