KIAA1797 je protein koji je kod ljudi kodiran genom KIAA1797.

Specifični jednonukleotidni polimorfizam rs7875153 u KIAA1797 povezan je sa srčanim pulsom. Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 1.801 aminokiselina, а molekulska težina 200.072 Da.

1020304050 MSDDIRKRFEFPNSLIQSQAVGHLIAAVLKENGFSEKIHQSTNQTPALNL LWEKCCSDNVVVRTACCEGLVALVAQDHAEFSYVLNGILNLIPSTRNTHG LIKAIMHLLQMQALKEGQGGEKNIQSIYTIRNHPHPLITVLEHRPDCWPV FLQQLTAFFQQCPERLEVSCIQIMAPFLWYLYCEPSQLQEYAKLRLALLK VLLQPQVLCDKDQPSILEQQILQLCCDIVPCLQVKDLIQTTEAMMFIEEV CLSLLRHPVFWKIQLTQMSLQLLCVSEVSLKITGECSSSIHLLEHSVELL KEDFPVELVIIGIALLLLQTPASQQKPILNLALKLLSVTEDQKIPKSSLL LVMPILQILSSTALEDCISVDEEGPSRQQLALNLLEMIQQECYRDDHQKL SYKLVCPVTSMYGTIFTAWRILEVMTDSSAASDWLASVESLLPITAVIPA PAFLLLAHLLVEDKGQNLHQILKVTTELAQADSSQVPNLIPVLMFKLGRP LEPILYNDILYTLPKLGVHKVCIGQILRIIQLLGTTPRLRAVTLRLLTSL WEKQDRVYPELQRFMAVSDVPSLSVGKEVQWEKLIAKAASIRDICKQRPY QHGADMLAAISQVLNECTKPDQATPAALVLQGLHALCQAEVVCIRSTWNA LSPKLSCDTRPLILKTLSELFSLVPSLTVNTTEYENFKVQVLSFLWTHTQ NKDPIVANAAYRSLANFTAGEHTILHLPEKIRPEIPIPEELDDDEDVEDV DLSVPGSCYLKLLSLTPPLVLPALEEFFTSLVKQEMVNMPRGIYHSALKG GARSDQGKTVAGIPNFILKMYETNKQPGLKPGLAGGMLFCYDVSMYQSKD GKPLNRLMASRGRSFKQTSLALVHEVHIQLSEWHRAIFLPQAWLAYMNRA YHAILQGRLGELELQLKHGKEEPEEVQYKKSTAWLWVRDMLTDEITKAAA KESPVVKGNALLALSSLAVVVSRHEASLSSDSDGLLEVQPNFLSMKEWVS MVLDTLLVIVDSHYQPRGQLLSWFYYKSYSGENTASAIARSAAATALSLL VPVFIISCKEKVEEILNMLTARLPGKPSADESQAVQIHMGLALGMFLSRL CEEKLSDISGQEMNLLLMKSLDALENCCFDTSLEYNTGCILGVGLVLSLM SHSSQMQSRVHVAALLRKLSAHVDDSGSQSRTFQEVLAYTLSCVCTSAFS AGIIEATEAEDVMNKLRLLVENSQQTSGFALALGNIVHGLSVCGHGKAED LGSKLLPAWIRIVLTEGTPTMLCLAALHGMVALVGSEGDVMQLKSEAIQT SHFQGRLNEVIRTLTQVISVSGVIGLQSNAVWLLGHLHLSTLSSSQSRAS VPTDYSYLPESSFIGAAIGFFITGGKKGPESVPPSLLKVVMKPIATVGES YQYPPVNWAALLSPLMRLNFGEEIQQLCLEIMVTQAQSSQNAAALLGLWV TPPLIHSLSLNTKRYLLISAPLWIKHISDEQILGFVENLMVAVFKAASPL GSPELCPSALHGLSQAMKLPSPAHHLWSLLSEATGKIFDLLPNKIRRKDL ELYISIAKCLLEMTDDDANRIAQVTKSNIEKAAFVKLYLVSQGRFPLVNL TDMLSVAVQHREKEVLAWMILHSLYQARIVSHANTGVLKRMEWLLELMGY IRNVAYQSTSFHNTALDKALDFFLLIFATAVVAWADHTAPLLLGLSASWL PWHQENGPAGPVPSFLGRSPMHRVTLQEVLTLLPNSMALLLQKEPWKEQT QKFIDWLFSIMESPKEALSAQSRDLLKATLLSLRVLPEFKKKAVWTRAYG W

Gen KIAA1797 je gen koji kodira proteine vrste Homo sapiens. Alternativni nazivi za gen su FLJ20375, OTTHUMP00000069845 i hipotetski protein LOC54914. Lociran je na hromosomu 9, sekvenca q21.3,AceView NCBI Gene Information AceView gdje cijeli gen uključujući introne i egzone sa 375.010 parova baza na plus lancu. Postoji 19 alternativnih varijanti prerade. Najduža varijanta daje iRNK od 6117 parova baza.

= Ekspresija

Utvrđeno je da se KIAA1797 eksprimira sveprisutno na različitim nivoima u cijelom ljudskom tijelu. Na osnovu EST profila Unigene, zapažena je ekspresija 'KIAA1797' u tkivima u rasponu od reproduktivnog do sekretornog.

350px|thumb|Raspon ekspresije KIAA1797

iRNK Predviđene sekundarne strukture iRNK u 5'UTR i 3'UTR su UGAGAUGAACUCGGUAUCUCA i UCCUAAGAGAGGAG. Druge moguće sekundarne strukture prikazane su u donjoj tabeli.

Proteinska sekvenca

Glavna izoforma ljudskog proteina duga je 1.801 aminokiselinu, ukupno 200.072 Da.

U sekvenci nalaze se dva različita domena nepoznate funkcije (DUF). DUF3730 (465-682aa) pojavljuje se dva puta u sekvenci; ova porodica domena nalazi se u eukariotima i obično ima između 220 i 262 aminokiseline DUF3028 (1213-1801aa). Nisu bile dostupne dodatne informacije o ovom DUF-u. DUF KIAA1797

Homologija

KIAA179 je dobro konzerviran među sisarima, ali se također nalazi i kod nesisarima sa nižim identitetima sekvence.

Gensko susjedstvo KIAA1797 je nizvodno od MLLT3 i uzvodno od PTPLAD2. MLLT3 je zahvaćen mijeloidnom/limfoidnom ili miješanom leukemijom. PTPLAD2 je protein tirozin-fosfataza.

Gensko predvorje KIAA1797

Funkcija

Naučna zajednica još ne razumije tačnu funkciju KIAA1797 . Utvrđeno je, međutim, da je transmembranski protein.

Reference

Dopunska literatura

Kategorija:Geni na hromosomu 9 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika