Podjedinica alfa mitohondrijsko-preradne peptidaze je enzim koji je kod ljudi kodiran genom PMPCA. Gen PMPCA kodira protein koji je član porodice peptidaza M16. Ovaj protein se nalazi u mitohondrijskom matriksu i katalizira cijepanje vodećih peptida prekursorskih proteina koji su tek uneseni u mitohondrije, iako funkcionira samo kao dio heterodimernog kompleksa.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 525 aminokiselina, а molekulska težina 58.253 Da. 1020304050 MAAVVLAATRLLRGSGSWGCSRLRFGPPAYRRFSSGGAYPNIPLSSPLPG VPKPVFATVDGQEKFETKVTTLDNGLRVASQNKFGQFCTVGILINSGSRY EAKYLSGIAHFLEKLAFSSTARFDSKDEILLTLEKHGGICDCQTSRDTTM YAVSADSKGLDTVVALLADVVLQPRLTDEEVEMTRMAVQFELEDLNLRPD PEPLLTEMIHEAAYRENTVGLHRFCPTENVAKINREVLHSYLRNYYTPDR MVLAGVGVEHEHLVDCARKYLLGVQPAWGSAEAVDIDRSVAQYTGGIAKL ERDMSNVSLGPTPIPELTHIMVGLESCSFLEEDFIPFAVLNMMMGGGGSF SAGGPGKGMFSRLYLNVLNRHHWMYNATSYHHSYEDTGLLCIHASADPRQ VREMVEIITKEFILMGGTVDTVELERAKTQLTSMLMMNLESRPVIFEDVG RQVLATRSRKLPHELCTLIRNVKPEDVKRVASKMLRGKPAVAALGDLTDL PTYEHIQTALSSKDGRLPRTYRLFR
C: Cistein D: Aspartat E: Glutamat F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Struktura Podjedinica alfa prekursorskog peptidaznog proteina je podjedinica za mitohondrijsku preradu veličine 58,2 KDa i sastavljena je od 525 aminokiselina. Proteinski prekursor sadrži 33-aminokiselinski N-terminalni fragment kao sekvencu za ciljanje mitohondrija. Nakon cijepanja, zreli protein PMPCA je veličine 54,6 KDa i ima teorijsku pI od 5,88.
Funkcija Peptidaza za preradu mitohondrija (MPP) je metaloendopeptidaza koja sadrži dvije strukturno povezane podjedinice, podjedinicu alfa i peptidaznu podjedinicu beta za preradu mitohondrija, koje u predviđenoj katalitskoj funkciji djeluju zajedno. Sadrži katalitsko mjesto, PMPCB protein podjedinice beta koji cijepa predsekvence (tranzitne peptide) iz prekursora mitohondrijskih proteina i oslobađa tranzitne peptide N-terminala iz proteinskog prekursora unesenih u mitohondrije, obično s argom u položaju P2.
Interakcije Kao podjedinica alfa peptidaze za preradu mitohondrija, PMPCA tvori heterodimer sa podjedinicom PMPCB.
Klinički značaj Većina mitohondrijskih proteina je jedarno kodirana, što zahtijeva pravilnu translokaciju proteina koji ciljaju na mitohondrije. Mnogi mitohondrijski proteini sintetizirani su u obliku prekursora koji sadrži sekvence usmjerene na mitohondrije. Ove prekursore obično cijepaju peptidaze i proteaze, prije nego što stignu na svoja podorganelna mjesta.
Vjerojatno je da je promijenjena aktivnost mitohondrijskih preradmih peptidaza bitna za osiguravanje pravilnog sazrijevanja mitohondrijskih proteina i da promijenjena aktivnosti ovih proteaza ima dramatične učinke na aktivnost, stabilnost i sastavljanje mitohondrijskih proteina. Dokazi su pokazali da je MPP uključen u proteolitsko sazrijevanje frataksina, proteina odgovornog za homeostazu gvožđa. U skladu s tim, pokazalo se da je nedostatak MPP uključen u Friedreichovu ataksiju, autosomni recesivni neurodegenerativni poremećaj.
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Mitohondrijski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 9 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Enzimi Kategorija:Proteomika