ZC3HC1

Antivirusni protein 1 cinkovog prsta tipa CCCH jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ZC3HAV1.

Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 902 aminokiseline, а molekulska težina 101.431 Da.

1020304050 MADPEVCCFITKILCAHGGRMALDALLQEIALSEPQLCEVLQVAGPDRFV VLETGGEAGITRSVVATTRARVCRRKYCQRPCDNLHLCKLNLLGRCNYSQ SERNLCKYSHEVLSEENFKVLKNHELSGLNKEELAVLLLQSDPFFMPEIC KSYKGEGRQQICNQQPPCSRLHICDHFTRGNCRFPNCLRSHNLMDRKVLA IMREHGLNPDVVQNIQDICNSKHMQKNPPGPRAPSSHRRNMAYRARSKSR DRFFQGSQEFLASASASAERSCTPSPDQISHRASLEDAPVDDLTRKFTYL GSQDRARPPSGSSKATDLGGTSQAGTSQRFLENGSQEDLLHGNPGSTYLA SNSTSAPNWKSLTSWTNDQGARRKTVFSPTLPAARSSLGSLQTPEAVTTR KGTGLLSSDYRIINGKSGTQDIQPGPLFNNNADGVATDITSTRSLNYKST SSGHREISSPRIQDAGPASRDVQATGRIADDADPRVALVNDSLSDVTSTT SSRVDDHDSEEICLDHLCKGCPLNGSCSKVHFHLPYRWQMLIGKTWTDFE HMETIEKGYCNPGIHLCSVGSYTINFRVMSCDSFPIRRLSTPSSVTKPAN SVFTTKWIWYWKNESGTWIQYGEEKDKRKNSNVDSSYLESLYQSCPRGVV PFQAGSRNYELSFQGMIQTNIASKTQKDVIRRPTFVPQWYVQQMKRGPDH QPAKTSSVSLTATFRPQEDFCFLSSKKYKLSEIHHLHPEYVRVSEHFKAS MKNFKIEKIKKIENSELLDKFTWKKSQMKEEGKLLFYATSRAYVESICSN NFDSFLHETHENKYGKGIYFAKDAIYSHKNCPYDAKNVVMFVAQVLVGKF TEGNITYTSPPPQFDSCVDTRSNPSVFVIFQKDQVYPQYVIEYTEDKACV IS

Struktura

Gen Gen ZC3HC1 nalazi se na hromosomu 7 u pojasu 7q32.2 i uključuje 14 egzona.

Protein NIPA je E3 ligaza od 60 kDa koja sadrži jednu C3HC tip cinkovog prsta i jednu regiju sličnu F-kutiji. Štaviše, 50-aminokiselinska (aminokiseline 352-402) regija na svom C-terminalu služi kao [ signal jedarne translokacije (NLS sekvenca), dok se predlaže da regija s 96 ostataka (aminokiseline 306-402) služi kao domen koji veže fosfotirozin. NIPA je jedna komponenti jedarnog kompleksa SCFNIPA, a pokazalo se da fosforilacija NIPA u tri serinska ostatka, Ser-354, Ser-359 i Ser-395 inaktivira kompleks u cjelini.

Funkcija

NIPA je široko eksprimiran u ljudskim tkivima, s najvećom ekspresijom u srcu, skeletnim mišićima i sjemenicima. To je ljudski F-kutijski protein koji definira ubikvitinski E3-tip SCF, čija se forma regulira fosforilacijom ovisnom o ćelijskom ciklusu NIPA. Ciklin B1, bitan za ulazak u mitozu, cilja SCFNIPA u međufazi. Fosforilacija NIPA-e javlja se u G2 fazi, rezultira disocijacijom NIPA -e iz jedarnog SCF-a i dokazano je kritična za pravilan prijelaz G2/M. Oscilirajuća ubikvitinacija jedarnog ciklina B1 pokretana kompleksom SCFNIPA doprinosi vremenu početka mitoze. Prijavljeno je i da NIPA odgađa apoptozu, a lokalizacija NIPA -e je potrebna za ovu antiapoptotsku funkciju.

Modelni organizmi

+ Fenotip Zc3hc1 nokaut-miša Svojstvo Fenotip Vijabilnost homozigota Nenormalan Studija letalne recesivnostiNormalan Plodnost homozigota Nenormalan Tjelesna težina Nenormalan Anksioznost otvorenog polja Nenormalan Neurološka procjenaNenormalan Snaga stiska Normalan Test vruće ploče Normalan Dismorfologija Nenormalan Indirektna kalorimetrija Nenormalan Test tolerancije glukoze Normalan Slušni odgovor moždanog stabla Normalan DEXA Nenormalan Radiografija Nenormalan Tjelesna temperatura Normalan Morfologija oka Normalan Klinička hemija Normalan Hematologija Nenormalan Limfociti periferne krvi Nenormalan Težina srcaNormalan Salmonella infekcija Normalan Citrobacter infekcija NormalanSvi testovi i analize su prema:Mouse Resources Portal, Wellcome Trust Sanger Institute. U studiji funkcije ZC3HC1 upotrebljeni su i modelni organizmi. Uvjetna linija nokaut-miševa zvana Zc3hc1tm1a(KOMP)Wtsi generirana je kao dio programa Međunarodnog konzorcija za nokaut-miševe — visokopropusnog projekta mutagenezeze za generiranje i distribuciju mutiranih životinjskih bolesti zainteresiranim naučnicima.

Mužjaci i ženke podvrgnuti su standardiziranom fenotipskom pregledu, kako bi se utvrdili efekti delecija. Na mutantnim miševima provedena su 22 ispitivanja i uočeno je jedanaest značajnih abnormalnosti. Manje od očekivanog, homozigotni mutantni miševi identificirani su pri odbijanju. Mutanti su bili subfertilni, sa smanjenom vertikalnom aktivnošću na otvorenom polju, smanjenom tjelesnom masom, smanjenim brojem rebara i smanjenim brojem ćelija. Mužjaci su također imali smanjenu tjelesnu težinu, abnormalno držanje i atipske nlaze indirektne kalorimetrije. Ženke su također imale abnormalno kratku njušku i atipiske krvne parametre.

Klinički značaj Kod ljudi, NIPA je bila uključena u kardiovaskularne bolestiu, studijama povezane sa genomom (GWAS). Konkretno, pokazalo se da jednonukleotidni polimorfizam (SNP) u ZC3HC1 predviđa koronarnu bolest. Ovo predviđanje neovisno o uobičajenim faktorima rizika za kardiovaskularne bolesti, poput visokog nivoa holesterola, visokog krvnog pritiska, gojaznosti, pušenja i šećerna bolest diabetes mellitus, koji su primarne mete postojećih tretmana za koronarnu bolest. Stoga bi proučavanje funkcije ovog gena moglo identificirati nove puteve koji doprinose koronarnoj arterijskoj bolesti koji rezultiraju razvojem novih terapeutika.

Klinički marker Na lokusu 7q32.2 povezanom s koronarnom arterijom samo je jedan SNP (rs11556924) povezan s rizikom od bolesti koronarne arterije, bez drugih varijanti u neravnoteži snažne veze. Rs11556924 SNP u genu ZC3HC1 dovodi do polimorfizma arginin-histidina na aminokiselinskom ostatku 363 u NIPA-i. Nadalje, rs11556924 je također povezan s promijenjenom debljinom karotidne intime-medija u pacijenata s reumatoidnim artritisom i s promijenjenim rizikom od atrijske fibrilacije.

Dodatno, studija o genetičkom riziku s više lokusa zasnovana na kombinaciji 27 lokusa, uključujući gen ZC3HC1, identificirala je osobe s povećanim rizikom i za incidentne i za ponavljajuće događaje koronarne arterijske bolesti, kao i za poboljšanu kliničku korist od terapije statinima. Studija se temeljila na kohortnoj studiji zajednice (studija Malmo Diet and Cancer) i četiri dodatna randomizirana kontrolirana ispitivanja kohorti primarne prevencije (JUPITER i ASCOT) i sekundarne kohorte prevencije (CARE i PROVE IT-TIMI 22).

Reference

Dopunska literatura

Kategorija:Mišji mutirani geni Kategorija:Geni na hromosomu 7 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika