thumb|right| ER translokonski kompleks. Mnogi proteinski kompleksi su uključeni u sintezu proteina. Stvarna proizvodnja odvija se u ribosomima (žuta i svijetloplava). Preko ER translokona (zeleno: Sec61, plavo: kompleks TRAP i crveno: kompleks oligosaharil-transferaze) novosintetizirani protein transportira se preko membrane (siva) u unutrašnjost ER-a. Sec61 je kanal za provođenje proteina, a OST dodaje proteinske šećere ostacima šećera. Translokon, poznat i kao translokator ili translokacijski kanal, je proteinski kompleks povezan sa translokacijama polipeptida, preko membrana.
Za eukariote, termin translokon se najčešće odnosi na kompleks koji transportira nastajuće polipeptid s ciljanom signalnom sekvencom u unutrašnji (cisternski ili lumenski) prostor endoplazmatskog retikuluma (ER ) iz citosola. Ovaj proces translokacije zahtijeva da protein pređe hidrofobni lipidni dvosloj. Isti kompleks se također koristi za integraciju nastajućih proteina u samu membranu (membranski protein). U prokariotima, sličan kompleks proteina prenosi polipeptide kroz (unutrašnju) plazmamembranu ili integrira membranske proteine. U drugom slučaju, proteinski kompleks aformira se od Sec proteina (Sec: sekrecijski), tvoreći kanal sa heterodimernim Sec61.
Kod prokariota, homologmi kompleks kanala poznat je kao SecYEG.
Translokacija Kanal omogućava peptidima kretanje u bilo kojem smjeru, pa su potrebni dodatni sistemi u translokonu za pomicanje peptida u određenom smjeru. Postoje tri tipa translokacije: kotranslacijska translokacija koja se događa kako se translacija događa, i dva tipa vrste posttranslacijske translokacije, koji se događaju nakon translacije, od kojih svaka vpostoji i kod eukariota i bakterija. Dok eukarioti razvijaju protein s BiP-om i koriste druge komplekse za transport peptida, bakterije koriste SecA ATPazu.
Posttranslacijski Kod eukariota, posttranslacijska translokacija ovisi o BiP-u i drugim kompleksima, uključujući kompleks SEC62/SEC63 integralnih membranskih proreina. U ovom načinu translokacije, Sec63 pomaže BiP da hidrolizira ATP, koji se zatim veže za peptid i "izvlači" ga. Ovaj proces se ponavlja za ostale molekule BiP, sve dok se cijeli peptid ne provuče.
Kod bakterija, isti proces odvija se "potiskivanjem" ATPaze poznate kao SecA, ponekad potpomognute kompleksom SecDF s druge strane odgovorne za povlačenje. SecA ATPaza koristi mehanizam "guraj-i-klizi" za pomicanje polipeptida kroz kanal. U stanju vezanom za ATP, SecA stupa u interakciju kroz prste sa dvije spirale sa podskupinom aminokiselina u supstratu, gurajući ih (hidrolizom ATP-a) u kanal. Interakcija je tada oslabljena kako SecA ulazi u stanje vezano za ADP, omogućavajući polipeptidnom lancu da pasivno klizi u bilo kojem smjeru. SecA zatim uzima još jedan dio peptida da ponovi postupak.
Također pogledajte SecY protein Sec61 Translokacija Bakterijski sistem sekrecije
Reference
Kategorija:Proteinski kompleksi Kategorija:Integralni membranski proteini Kategorija:Ciljanje proteina Kategorija:Biomolekule