Interferonom-inducirani gvanilat-vezujući protein 2 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom GBP2 sa hromosoma 1. GBP2 je gen koji se odnosi na natporodicu velikih GTPaza koje se mogu inducirati uglavnom interferonom gama.
Amiokiselininska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 591 aminokiselina, a molekulska težina 67.209 Da.
1020304050 MAPEINLPGPMSLIDNTKGQLVVNPEALKILSAITQPVVVVAIVGLYRTG KSYLMNKLAGKKNGFSLGSTVKSHTKGIWMWCVPHPKKPEHTLVLLDTEG LGDIEKGDNENDSWIFALAILLSSTFVYNSMGTINQQAMDQLHYVTELTD RIKANSSPGNNSVDDSADFVSFFPAFVWTLRDFTLELEVDGEPITADDYL ELSLKLRKGTDKKSKSFNDPRLCIRKFFPKRKCFVFDWPAPKKYLAHLEQ LKEEELNPDFIEQVAEFCSYILSHSNVKTLSGGIPVNGPRLESLVLTYVN AISSGDLPCMENAVLALAQIENSAAVEKAIAHYEQQMGQKVQLPTETLQE LLDLHRDSEREAIEVFMKNSFKDVDQMFQRKLGAQLEARRDDFCKQNSKA SSDCCMALLQDIFGPLEEDVKQGTFSKPGGYRLFTQKLQELKNKYYQVPR KGIQAKEVLKKYLESKEDVADALLQTDQSLSEKEKAIEVERIKAESAEAA KKMLEEIQKKNEEMMEQKEKSYQEHVKQLTEKMERDRAQLMAEQEKTLAL KLQEQERLLKEGFENESKRLQKDIWDIQMRSKSLEPICNIL
Struktura Analiza sekvence GBP2 pokazala je prisustvo RNK-vezujućeg domena koji se sastoji od tri motiva prepoznavanja RNK (RRM) i SR domena. Amino terminal GBp2 dijeli četiri motiva ponavljanja Arg-Gly-Gly (RGG) i devet serinskih ostataka u kontekstu arginin/serinskih motiva.
SR domen GBP2 je mjesto fosforilacija za SR specifičnu protein-kinazu SRPK (sky1) koja usmjerava jedarnu lokalizaciju GBP2.
Svinjski GBP2 ima veliku sličnost u pogledu N-terminala koji je globulski domen i sadrži funkciju GTPaza. Međutim, C-terminal ima spiralni domen koji je manje konzerviran.
Funkcija
Interferoni su citokini koji imaju antivirusne efekte i inhibiraju ćelijsku proliferaciju tumora. Indukuju veliki broj gena u svojim ciljnim ćelijama, uključujući i one koji kodiraju gvanilat-vezujući protein (GBP). GBP se odlikuju sposobnošću da specifično vežu guaninske nukleotide (GMP, GDP i GTP). Protein kodiran ovim genom je GTPaza koja pretvara GTP u GDP i GMP. Osim toga, GBP2 gen može biti veza između površinskih ćelijskih receptore i unutarćelijskih efektora koji mogu prenijeti vanćelijske informacije u ćelije, kao i unutarćelijski signalni transdukcijski protein.
Studija na goveđem genu GBP2 pokazala je važnost GBP2 u regulaciji proliferacije ćelija i otpornosti na infekciju patogenom, kao što je Izlaganje antivirusnoj aktivnosti protiv virusa gripe.
GPB2 promovira oksidativno ubijanje i isporučuje antimikrobne peptide u autofagolizosom, pružajući široku zaštitu domaćina od različitih klasa patogena. Tokom virusne infekcije, porodica GBP (GBP1, GBP2 i GBP5) ima vitalnu ulogu u aktiviranju kanonskog i nekanonskog inflamasoma na odgovor na infekciju patogenom putem Chlamydia muridarum.
Lokalizacija Gen GBP2 nalazi se u različitim odjeljcima u ćeliji: jedro, citosol i citoskelet, a također se dimer GBP2-GBP5 nalazi u Golgijevom aparatu.
Osim toga, za regulaciju unutarćelijske lokalizacije i membranske asocijacije GBP2 potrebna je i izoprenilacija.
Aktivacija Mišji gen GBP2 nije samo visoko aktiviran interferon-gama tokom aktivacije makrofaga, već i stimulacijom Tol-likih receptore, faktora nekroze tumora (TNF) i interleukina-1 beta.
Ekspresija Nakon stimulacije interferonom gama, mišji GPB2 eksprimira se u urođenim i prilagodljivim imunskim ćelijama.
Interakcija Gen GBP2 može komunicirati sa RNK, preko domena RRM1 i RRM2. RRM2 domen može prepoznati osnovni motiv GGUC prisutan u RNK. Osim toga, identificiran je novi tip RRM domena koji može komunicirati sa kompleksom THO/TREX.
Gen GBp2 može surađivati sa TREX (transkripcija-eksport) kompleksom; multimerni kompleks ima različite transkripcijske i eksportne faktore kao što su Yra1 i Sub2.
Klinički značaj
Genska mutacija Kod pacijenata s migrenom identificirana je misens mutacija GBP2 (A907G). U prvom koraku može dovesti do vazomotorne disfunkcije, a zatim do glavobolje.
Rak dojke GBP2 se smatra kontrolnim faktorom za proliferaciju i širenje u tumorskoj ćeliji. Visoka ekspresija GBP2 povezana je s boljom dijagnozom raka dojke. P53 može regulirati GBP2 i imati esencijalnu ulogu u razvoju tumora, inhibicijom metaloproteinaze MM9 kao i NF-Kappa B i proteina Rac.
Nivo transkripcije GBP2 također je reguliran i putem dva faktora transkripcije STAT1 i IRF1. Ekspresija GBP2 ima jaku korelaciju sa metagenom T-ćelija što se čini povezanom sa infiltracijom T-ćelija u rak dojke.
Međutim, nedavna studija je pokazala da GBP2 može regulirati protein 1 (Drp1) povezan s dinaminom, kako bi blokirao translokaciju Drp1 u mitohondrije, što dovodi do slabljenja Drp1 ovisne mitohondrijske fisije i također invazija ćelija raka dojke.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 1 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika