Transmembranski protein 69 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM69 sa hromosoma 1. A notable feature of the protein encoded by TMEM69 is the presence of five transmembrane segments.
Polazne informacije Pristupni brojLokacijaIdentifikatoriM.W.pIiRNK: NM_016486.3 protein: NP_057570.2 1p34.1 HSPC229, C1orf154, FLJ21029, LOC5124927,6 kDa10,3
Funkcija Naučna zajednica još uvijek ne razumije tačnu funkciju TMEM69. Međutim, smatra se da ima ulogu proteina skele u kompleksu receptora prerađenog G-proteina u Xenopus tropicalis. Pokazalo se da formira klaster sa xtGPR54-2 genom IPP i GPBP1 u skeli_41. Ovaj kompleks je dio G-protein spregnutog receptora koji djeluje kao receptor za vezivni ligand, kispeptin u plazmamembrani moždanih ćelija.
Aminokiselinska sekvenca Dužina polipeptidnog lanca je 247 aminokiselina, a molekulska težina 27.551 Da.
1020304050 MLRFIQKFSQASSKILKYSFPVGLRTSRTDILSLKMSLQQNFSPCPRPWL SSSFPAYMSKTQCYHTSPCSFKKQQKQALLARPSSTITYLTDSPKPALCV TLAGLIPFVAPPLVMLMTKTYIPILAFTQMAYGASFLSFLGGIRWGFALP EGSPAKPDYLNLASSAAPLFFSWFAFLISERLSEAIVTVIMGMGVAFHLE LFLLPHYPNWFKALRIVVTLLATFSFIITLVVKSSFPEKGHKRPGQV
Protein TMEM69 je dug 247 aminokiselina. Prisutno je pet transmembranskih segmenata, kao i domen nepoznate funkcije, DUF3429, koji obuhvata aminokiseline 91-232.
middle
Gen Gen TMEM69, lociran na hromosomskoj regiji 1p34.1, pokrivajući 7,24 kb. Nalazi se na plus lancu u genomskoj sekvenci od 46152886 do 46160121 i kodira primarni iRNK transkript koji sadrži tri egzona, a dužina je 6262 bp. Predviđeno je da gen TMEM69 kodira tri alternativna transkripta .
Gensko susjedstvo GenLokacijaOrijentacijaFunkcija GPBP1L1 (GC-bogati promotor-vezijući protein 1-liki 1)1p34.1minusRegulacija tranakripcijw CCDC17 (Protein sa upredenom zavojnicom 17)1p34.1minusBez informacuja funcionalnosti MAST2 (Mikrotubulama pidružena serin/treonin kinaza 2)1p34.1plus Funkcije u multiproteinskom Kompleksu u sazrevanju spermatozoida. Regulira sintezu IL-12 izazvanu lipopolisaharidima u makrofagovima [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3652 IPP (Unutarcisternski polipeptid promoviran česticama1p34-p32minusInterakcija sa aktinom
Predviđena svojstva Svojstva TMEM69 koja su predviđena pomoću bioinformatučkih alata: Molekulska težina: 27,6 KDa. Izoelektrična tačka: 10,3 Posttranslacijske modifikacije: Višestruka mjesta fosforilacije predviđena su iz NetPhos programa na ExPASy . NetPhos ih je predvidio sedam za aminokiselinu serin: na pozicijama 12, 27, 33, 85, 93, 183 i 234; jedno za treonin na poziciji 26 i dva za tirozin: na pozicijama 57 i 159. NetGlyc na ExPASy je predvidio pet glikacijskih mjesta na pozicijama 7, 60, 73, 156 i 239. Transmembranski segmenti: TMEM69 sadrži pet transmembranskih regiona koji se nalaze na pozicijama 97–117, 122–142, 159–179, 185–205 i 216–236.
Ekspresija TMEM69 se eksprimira sveprisutno na niskim nivoima u cijelom ljudskom tijelu, iako podaci EST profila otkrivaju da je TMEM69 posebno izražen u neuroendokrinim tkivima kao što su jetra, amigdala, hipokampus i hipotalamus. Utvrđeno je da je TMEM69 eksprimiran u vrijednostima nižim od normalnih kod pacijenata koji pate od ateroskleroze.
Homologija
Ortolozi Gen TMEM69 duboko je očuvan u nekoliko životnih oblika. Iako pokazuje najveću očuvanost među ortolozima sisavaca, zajedno s drugim hordati kao što su ribe, ptice i vodozemci, postoji određena očuvanost kod biljaka, insekata, gljiva i bakterija.
Rod i vrstaUobičajeno imePristupni brokIdentitet sekvenceDužina (AA) Macaca fascicularisRakojedi makakEHH61428.189%246 Callithrix jacchusRepati majmunXP_002750811.183%249 Mus musculusKućni mišAAI06179.169%245 Xenopus tropicalisAfrička kandžasta žabaNP_001016103.149%253 Rattus norvegicusPacovEDL90276.1 70%247 Oryctolagus cuniculusKunićXP_002715715 74%250 Anolis carolinensisGušterXP_003220264.150%257 Danio rerioZebricaXP_685684.149%249 Salmo salarLososNP_001134056.150%259 Daphia pulexVodena buhaEFX84634.135%208 Ostreococcus tauriZelena algaXP_003081614.134%166 Pseudomonas putida W619Zemna bakterijaYP_001748891.132%152 Schizophyllum communeGljivaXP_003035659.127%363
Paralozi Nisu pronađeni paralozi za TMEM69.
Konzerviranost TMEM69 je dobro konzerviran u različitim organizmima. Iako se većina ortologa nalazi kod placentnih sisara, neki ortolozi se nalaze u bakterijama i gljivama. Najudaljeniji ortolog za koji je utvrđeno da ima sličnost sekvence sa TMEM69 je Pseudomonas putida W619, koja je vrsta zemljišne bakterije. Posebno dobro konzerviran čak i kod najudaljenijih ortologa, uključujući Pseudomonas putida W619, najveći je dio drugog transmembranski domen|transmembranskog segmenta TMEM69. U strogim ortolozima svih pet transmembranskih domena je očuvano. Konzervirani domeni pronađeni unutar TMEM69, dio su DUF3429, porodice nekarakterističnih proteina pronađenih u bakterijama i eukariotima.
Reference
Kategorija:Geni na hromosomu 1 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Transmembranski proteini Kategorija:Proteomika