U enzimologiji, amidaza (EC 3.5.1.4, acilamidaza, acilaza (obmanjujuće), amidohidrolaza (dvosmisleno) , deaminaza (dvosmisleno), masna acilamidaza, N-acetilaminohidrolaza (dvosmisleno) je enzim koji katalizira hidrolizu amida: 400px
Dakle, dva supstrata ovog enzima su amid i H2O, dok su njegova su dva proizvoda monokarboksilat i NH3.
Ovaj enzim pripada porodici hidrolaza, onih koji djeluju na veze ugljik-dušik, osim na peptidne veze, posebno u linearnim amidima. Sistematski naziv ove klase enzima je acilamid amidohidrolaza. Drugi nazivi u uobičajenoj upotrebi su acilamidaza, acilaza, amidohidrolaza, deaminaza, masna acilamidaza i 'N-acetilaminohidrolaza'. Ovaj enzim učestvuje u šest metaboličkih puteva: ciklus ureje i metabolizam amino grupa, metabolizam fenilalanina, metabolizam triptofana, metabolizam cijanoaminokiselina, koagulacijska razgradnja benzoata i razgradnja stirena. Amidaze sadrže konzerviranu dionicu od približno 130 aminokiselina, poznatu kao AS sekvenca. Široko su rasprostranjene; nalaze se i kod prokariot a i eukariot a. AS enzimi katalizuju hidrolizu amida. Karakteristična je veza (CO-NH2), iako se porodica uveliko razilazi u pogledu specifičnosti i funkcija enzimskog supstrata. Ipak, ovi enzimi održavaju alfa/beta/alfa strukturu jezgra, gdje su topologije N- i C-terminalnih polovina slične. AS enzimi karakteristično imaju visoko konzerviranu C-terminalnu regiju bogatu serinskim i glicinskim ostacima, ali bez ostataka asparaginske kiseline i histidin a, stoga razlikuju se od klasičnih serinskih hidrolaza. Ovi enzimi imaju jedinstvenu, visoko konzerviranu Ser-Ser-Lys katalitsku trijadu koja se koristi za hidrolizu amida, iako se katalitski mehanizam za formiranje acil-enzim intermedijera može razlikovati između enzima.
Primjeri enzima koji sadrže AS potpis uključuju:
Peptidna amidaza (Pam), koja katalizira hidrolizu C-terminalne amidne veze peptida. Masnokiselinske amid-hidrolaze, koje hidroliziraju masne kiseline u sredini supstrata (npr. kanabinoid anandamid i oleamid koji indukuje san), čime se kontrolira nivo i trajanje signalizacije [ [Regulacija ekspresije gena|indukovane]] ovom raznolikom klasom lipidnih transmittera. malonamidaza E2, koja katalizira hidrolizu malonamata u malonat i amonijak, a koji je uključen u transport fiksiranog dušik a od bakteroida do bioljnih ćelija u simbiotskom metabolizmu dušika. Podjedinica A Glu-tRNA(Gln) amidotransferaze, heterotrimerni enzim koji katalizuje formiranje Gln-tRNA(Gln) transamidacijom misacilirane Glu-tRNA(Gln) putem amidolize glutamina.
Strukturne studije
Do kraja 2018. riješeno je 162 struktura za ovu porodicu, kojima se može pristupiti na Pfam .
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Proteinske porodice Kategorija:EC 3.5.1 Kategorija:Enzimi poznate strukture